Protein–RNA interactions for Protein: O54956

Pole2, DNA polymerase epsilon subunit 2, mousemouse

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pole2O54956 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pole2O54956 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pole2O54956 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pole2O54956 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pole2O54956 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pole2O54956 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Pole2O54956 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Pole2O54956 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Pole2O54956 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Pole2O54956 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Pole2O54956 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Pole2O54956 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Pole2O54956 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Pole2O54956 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Pole2O54956 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Pole2O54956 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Pole2O54956 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Pole2O54956 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Pole2O54956 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Pole2O54956 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pole2O54956 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pole2O54956 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pole2O54956 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pole2O54956 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pole2O54956 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pole2O54956 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pole2O54956 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pole2O54956 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pole2O54956 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pole2O54956 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Pole2O54956 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pole2O54956 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pole2O54956 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pole2O54956 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pole2O54956 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pole2O54956 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pole2O54956 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pole2O54956 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pole2O54956 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pole2O54956 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pole2O54956 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pole2O54956 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pole2O54956 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pole2O54956 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pole2O54956 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pole2O54956 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pole2O54956 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pole2O54956 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pole2O54956 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pole2O54956 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pole2O54956 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pole2O54956 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pole2O54956 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pole2O54956 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pole2O54956 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pole2O54956 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pole2O54956 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pole2O54956 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Pole2O54956 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pole2O54956 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Pole2O54956 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pole2O54956 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pole2O54956 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pole2O54956 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pole2O54956 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pole2O54956 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pole2O54956 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pole2O54956 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pole2O54956 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pole2O54956 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pole2O54956 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pole2O54956 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pole2O54956 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pole2O54956 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pole2O54956 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pole2O54956 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pole2O54956 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pole2O54956 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pole2O54956 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pole2O54956 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pole2O54956 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pole2O54956 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pole2O54956 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pole2O54956 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pole2O54956 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pole2O54956 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pole2O54956 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pole2O54956 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pole2O54956 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pole2O54956 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pole2O54956 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pole2O54956 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pole2O54956 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pole2O54956 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pole2O54956 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pole2O54956 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pole2O54956 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pole2O54956 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pole2O54956 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pole2O54956 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms