Protein–RNA interactions for Protein: O54946

Dnajb6, DnaJ homolog subfamily B member 6, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnajb6O54946 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Dnajb6O54946 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Dnajb6O54946 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Dnajb6O54946 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Dnajb6O54946 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Dnajb6O54946 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Dnajb6O54946 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Dnajb6O54946 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Dnajb6O54946 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Dnajb6O54946 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Dnajb6O54946 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Dnajb6O54946 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Dnajb6O54946 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Dnajb6O54946 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Dnajb6O54946 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Dnajb6O54946 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Dnajb6O54946 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Dnajb6O54946 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Dnajb6O54946 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Dnajb6O54946 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Dnajb6O54946 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Dnajb6O54946 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Dnajb6O54946 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Dnajb6O54946 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Dnajb6O54946 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Dnajb6O54946 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Dnajb6O54946 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Dnajb6O54946 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Dnajb6O54946 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Dnajb6O54946 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Dnajb6O54946 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Dnajb6O54946 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Dnajb6O54946 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Dnajb6O54946 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Dnajb6O54946 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Dnajb6O54946 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Dnajb6O54946 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Dnajb6O54946 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Dnajb6O54946 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Dnajb6O54946 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Dnajb6O54946 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Dnajb6O54946 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Dnajb6O54946 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Dnajb6O54946 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Dnajb6O54946 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Dnajb6O54946 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Dnajb6O54946 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Dnajb6O54946 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Dnajb6O54946 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Dnajb6O54946 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Dnajb6O54946 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Dnajb6O54946 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Dnajb6O54946 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Dnajb6O54946 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Dnajb6O54946 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Dnajb6O54946 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Dnajb6O54946 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Dnajb6O54946 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Dnajb6O54946 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Dnajb6O54946 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Dnajb6O54946 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Dnajb6O54946 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Dnajb6O54946 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Dnajb6O54946 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Dnajb6O54946 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Dnajb6O54946 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Dnajb6O54946 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Dnajb6O54946 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Dnajb6O54946 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Dnajb6O54946 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Dnajb6O54946 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Dnajb6O54946 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Dnajb6O54946 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Dnajb6O54946 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Dnajb6O54946 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Dnajb6O54946 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Dnajb6O54946 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Dnajb6O54946 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Dnajb6O54946 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Dnajb6O54946 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Dnajb6O54946 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Dnajb6O54946 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Dnajb6O54946 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Dnajb6O54946 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Dnajb6O54946 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Dnajb6O54946 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Dnajb6O54946 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Dnajb6O54946 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Dnajb6O54946 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Dnajb6O54946 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Dnajb6O54946 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Dnajb6O54946 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Dnajb6O54946 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Dnajb6O54946 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Dnajb6O54946 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Dnajb6O54946 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Dnajb6O54946 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Dnajb6O54946 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Dnajb6O54946 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Dnajb6O54946 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms