Protein–RNA interactions for Protein: O54890

Itgb3, Integrin beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 787 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb3O54890 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Itgb3O54890 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Itgb3O54890 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Itgb3O54890 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Itgb3O54890 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Itgb3O54890 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Itgb3O54890 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Itgb3O54890 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Itgb3O54890 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Itgb3O54890 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Itgb3O54890 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Itgb3O54890 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Itgb3O54890 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Itgb3O54890 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Itgb3O54890 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Itgb3O54890 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Itgb3O54890 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Itgb3O54890 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Itgb3O54890 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Itgb3O54890 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Itgb3O54890 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Itgb3O54890 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Itgb3O54890 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Itgb3O54890 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Itgb3O54890 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Itgb3O54890 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Itgb3O54890 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Itgb3O54890 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Itgb3O54890 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Itgb3O54890 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Itgb3O54890 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Itgb3O54890 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Itgb3O54890 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Itgb3O54890 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Itgb3O54890 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Itgb3O54890 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Itgb3O54890 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Itgb3O54890 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Itgb3O54890 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Itgb3O54890 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Itgb3O54890 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Itgb3O54890 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Itgb3O54890 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Itgb3O54890 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Itgb3O54890 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Itgb3O54890 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Itgb3O54890 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Itgb3O54890 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Itgb3O54890 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Itgb3O54890 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Itgb3O54890 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Itgb3O54890 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Itgb3O54890 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Itgb3O54890 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Itgb3O54890 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Itgb3O54890 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Itgb3O54890 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Itgb3O54890 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Itgb3O54890 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Itgb3O54890 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Itgb3O54890 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Itgb3O54890 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Itgb3O54890 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Itgb3O54890 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Itgb3O54890 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Itgb3O54890 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Itgb3O54890 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Itgb3O54890 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Itgb3O54890 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Itgb3O54890 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Itgb3O54890 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Itgb3O54890 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Itgb3O54890 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC21.2■□□□□ 0.99
Itgb3O54890 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Itgb3O54890 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Itgb3O54890 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Itgb3O54890 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Itgb3O54890 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Itgb3O54890 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Itgb3O54890 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Itgb3O54890 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Itgb3O54890 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Itgb3O54890 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Itgb3O54890 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Itgb3O54890 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Itgb3O54890 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Itgb3O54890 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Itgb3O54890 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Itgb3O54890 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Itgb3O54890 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Itgb3O54890 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Itgb3O54890 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Itgb3O54890 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Itgb3O54890 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Itgb3O54890 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Itgb3O54890 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Itgb3O54890 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Itgb3O54890 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Itgb3O54890 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Itgb3O54890 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms