Protein–RNA interactions for Protein: O54833

Csnk2a2, Casein kinase II subunit alpha', mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk2a2O54833 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Csnk2a2O54833 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Csnk2a2O54833 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Csnk2a2O54833 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Csnk2a2O54833 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Csnk2a2O54833 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Csnk2a2O54833 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Csnk2a2O54833 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Csnk2a2O54833 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Csnk2a2O54833 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Csnk2a2O54833 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Csnk2a2O54833 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Csnk2a2O54833 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Csnk2a2O54833 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Csnk2a2O54833 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Csnk2a2O54833 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Csnk2a2O54833 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Csnk2a2O54833 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Csnk2a2O54833 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Csnk2a2O54833 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Csnk2a2O54833 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Csnk2a2O54833 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Csnk2a2O54833 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Csnk2a2O54833 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Csnk2a2O54833 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Csnk2a2O54833 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Csnk2a2O54833 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Csnk2a2O54833 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Csnk2a2O54833 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Csnk2a2O54833 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Csnk2a2O54833 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Csnk2a2O54833 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Csnk2a2O54833 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Csnk2a2O54833 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Csnk2a2O54833 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Csnk2a2O54833 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Csnk2a2O54833 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Csnk2a2O54833 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Csnk2a2O54833 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Csnk2a2O54833 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Csnk2a2O54833 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Csnk2a2O54833 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Csnk2a2O54833 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Csnk2a2O54833 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Csnk2a2O54833 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Csnk2a2O54833 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Csnk2a2O54833 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Csnk2a2O54833 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Csnk2a2O54833 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Csnk2a2O54833 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Csnk2a2O54833 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Csnk2a2O54833 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Csnk2a2O54833 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Csnk2a2O54833 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Csnk2a2O54833 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Csnk2a2O54833 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Csnk2a2O54833 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Csnk2a2O54833 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Csnk2a2O54833 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Csnk2a2O54833 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Csnk2a2O54833 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Csnk2a2O54833 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Csnk2a2O54833 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Csnk2a2O54833 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Csnk2a2O54833 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Csnk2a2O54833 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Csnk2a2O54833 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Csnk2a2O54833 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Csnk2a2O54833 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Csnk2a2O54833 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Csnk2a2O54833 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Csnk2a2O54833 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Csnk2a2O54833 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Csnk2a2O54833 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Csnk2a2O54833 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Csnk2a2O54833 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Csnk2a2O54833 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Csnk2a2O54833 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Csnk2a2O54833 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Csnk2a2O54833 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Csnk2a2O54833 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Csnk2a2O54833 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Csnk2a2O54833 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Csnk2a2O54833 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Csnk2a2O54833 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Csnk2a2O54833 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Csnk2a2O54833 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Csnk2a2O54833 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Csnk2a2O54833 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Csnk2a2O54833 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Csnk2a2O54833 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Csnk2a2O54833 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Csnk2a2O54833 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Csnk2a2O54833 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Csnk2a2O54833 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Csnk2a2O54833 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Csnk2a2O54833 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Csnk2a2O54833 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Csnk2a2O54833 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Csnk2a2O54833 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms