Protein–RNA interactions for Protein: O54786

Dffa, DNA fragmentation factor subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DffaO54786 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
DffaO54786 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
DffaO54786 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
DffaO54786 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
DffaO54786 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
DffaO54786 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
DffaO54786 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
DffaO54786 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
DffaO54786 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
DffaO54786 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
DffaO54786 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
DffaO54786 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
DffaO54786 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
DffaO54786 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
DffaO54786 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
DffaO54786 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
DffaO54786 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
DffaO54786 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
DffaO54786 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
DffaO54786 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
DffaO54786 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
DffaO54786 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
DffaO54786 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
DffaO54786 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
DffaO54786 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
DffaO54786 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
DffaO54786 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
DffaO54786 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
DffaO54786 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
DffaO54786 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
DffaO54786 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
DffaO54786 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
DffaO54786 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
DffaO54786 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
DffaO54786 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
DffaO54786 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
DffaO54786 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
DffaO54786 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
DffaO54786 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
DffaO54786 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
DffaO54786 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
DffaO54786 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
DffaO54786 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
DffaO54786 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
DffaO54786 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
DffaO54786 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
DffaO54786 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
DffaO54786 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
DffaO54786 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
DffaO54786 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
DffaO54786 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
DffaO54786 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
DffaO54786 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
DffaO54786 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
DffaO54786 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
DffaO54786 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
DffaO54786 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
DffaO54786 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
DffaO54786 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
DffaO54786 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
DffaO54786 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
DffaO54786 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
DffaO54786 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
DffaO54786 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
DffaO54786 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
DffaO54786 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
DffaO54786 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
DffaO54786 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
DffaO54786 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
DffaO54786 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
DffaO54786 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
DffaO54786 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
DffaO54786 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
DffaO54786 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
DffaO54786 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
DffaO54786 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
DffaO54786 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
DffaO54786 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
DffaO54786 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
DffaO54786 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
DffaO54786 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
DffaO54786 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
DffaO54786 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
DffaO54786 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
DffaO54786 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
DffaO54786 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
DffaO54786 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
DffaO54786 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
DffaO54786 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
DffaO54786 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
DffaO54786 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
DffaO54786 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
DffaO54786 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
DffaO54786 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
DffaO54786 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
DffaO54786 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
DffaO54786 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
DffaO54786 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
DffaO54786 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
DffaO54786 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms