Protein–RNA interactions for Protein: O35963

Rab33b, Ras-related protein Rab-33B, mousemouse

Predictions only

Length 229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab33bO35963 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rab33bO35963 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rab33bO35963 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rab33bO35963 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rab33bO35963 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rab33bO35963 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rab33bO35963 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rab33bO35963 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rab33bO35963 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rab33bO35963 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rab33bO35963 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rab33bO35963 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rab33bO35963 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rab33bO35963 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rab33bO35963 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rab33bO35963 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rab33bO35963 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rab33bO35963 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rab33bO35963 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rab33bO35963 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rab33bO35963 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rab33bO35963 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rab33bO35963 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rab33bO35963 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rab33bO35963 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rab33bO35963 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rab33bO35963 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rab33bO35963 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rab33bO35963 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rab33bO35963 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rab33bO35963 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Rab33bO35963 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rab33bO35963 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rab33bO35963 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rab33bO35963 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rab33bO35963 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rab33bO35963 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rab33bO35963 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rab33bO35963 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rab33bO35963 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rab33bO35963 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rab33bO35963 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rab33bO35963 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rab33bO35963 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rab33bO35963 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rab33bO35963 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rab33bO35963 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rab33bO35963 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rab33bO35963 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rab33bO35963 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rab33bO35963 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rab33bO35963 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rab33bO35963 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rab33bO35963 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rab33bO35963 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rab33bO35963 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rab33bO35963 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rab33bO35963 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rab33bO35963 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rab33bO35963 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Rab33bO35963 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rab33bO35963 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rab33bO35963 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rab33bO35963 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rab33bO35963 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rab33bO35963 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rab33bO35963 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rab33bO35963 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rab33bO35963 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rab33bO35963 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rab33bO35963 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rab33bO35963 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rab33bO35963 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rab33bO35963 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rab33bO35963 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rab33bO35963 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rab33bO35963 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rab33bO35963 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rab33bO35963 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Rab33bO35963 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rab33bO35963 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Rab33bO35963 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rab33bO35963 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Rab33bO35963 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rab33bO35963 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rab33bO35963 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rab33bO35963 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rab33bO35963 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Rab33bO35963 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rab33bO35963 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Rab33bO35963 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rab33bO35963 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rab33bO35963 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rab33bO35963 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rab33bO35963 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rab33bO35963 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rab33bO35963 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rab33bO35963 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rab33bO35963 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rab33bO35963 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms