Protein–RNA interactions for Protein: O35904

Pik3cd, Phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit delta isoform, mousemouse

Predictions only

Length 1,043 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pik3cdO35904 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Pik3cdO35904 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pik3cdO35904 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pik3cdO35904 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pik3cdO35904 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pik3cdO35904 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Pik3cdO35904 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Pik3cdO35904 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Pik3cdO35904 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Pik3cdO35904 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Pik3cdO35904 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Pik3cdO35904 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Pik3cdO35904 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Pik3cdO35904 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Pik3cdO35904 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Pik3cdO35904 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Pik3cdO35904 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC20.27■□□□□ 0.83
Pik3cdO35904 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Pik3cdO35904 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pik3cdO35904 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pik3cdO35904 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pik3cdO35904 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pik3cdO35904 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pik3cdO35904 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pik3cdO35904 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pik3cdO35904 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pik3cdO35904 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pik3cdO35904 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pik3cdO35904 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pik3cdO35904 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Pik3cdO35904 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pik3cdO35904 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pik3cdO35904 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pik3cdO35904 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pik3cdO35904 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Pik3cdO35904 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pik3cdO35904 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pik3cdO35904 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pik3cdO35904 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pik3cdO35904 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pik3cdO35904 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pik3cdO35904 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pik3cdO35904 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pik3cdO35904 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pik3cdO35904 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pik3cdO35904 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pik3cdO35904 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pik3cdO35904 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pik3cdO35904 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pik3cdO35904 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pik3cdO35904 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pik3cdO35904 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pik3cdO35904 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pik3cdO35904 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pik3cdO35904 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pik3cdO35904 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pik3cdO35904 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pik3cdO35904 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pik3cdO35904 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pik3cdO35904 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pik3cdO35904 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pik3cdO35904 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pik3cdO35904 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pik3cdO35904 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pik3cdO35904 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pik3cdO35904 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pik3cdO35904 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pik3cdO35904 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pik3cdO35904 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pik3cdO35904 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pik3cdO35904 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pik3cdO35904 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pik3cdO35904 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pik3cdO35904 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pik3cdO35904 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pik3cdO35904 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pik3cdO35904 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pik3cdO35904 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pik3cdO35904 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pik3cdO35904 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pik3cdO35904 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pik3cdO35904 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pik3cdO35904 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pik3cdO35904 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pik3cdO35904 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pik3cdO35904 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pik3cdO35904 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
Pik3cdO35904 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pik3cdO35904 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pik3cdO35904 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pik3cdO35904 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pik3cdO35904 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pik3cdO35904 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pik3cdO35904 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pik3cdO35904 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pik3cdO35904 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pik3cdO35904 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pik3cdO35904 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pik3cdO35904 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pik3cdO35904 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.5 ms