Protein–RNA interactions for Protein: O35599

Opn1mw, Medium-wave-sensitive opsin 1, mousemouse

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Length 359 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn1mwO35599 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Opn1mwO35599 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Opn1mwO35599 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Opn1mwO35599 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Opn1mwO35599 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Opn1mwO35599 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Opn1mwO35599 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Opn1mwO35599 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Opn1mwO35599 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Opn1mwO35599 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Opn1mwO35599 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Opn1mwO35599 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Opn1mwO35599 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Opn1mwO35599 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Opn1mwO35599 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Opn1mwO35599 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Opn1mwO35599 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Opn1mwO35599 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Opn1mwO35599 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Opn1mwO35599 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Opn1mwO35599 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Opn1mwO35599 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Opn1mwO35599 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Opn1mwO35599 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Opn1mwO35599 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Opn1mwO35599 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Opn1mwO35599 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Opn1mwO35599 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Opn1mwO35599 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Opn1mwO35599 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Opn1mwO35599 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Opn1mwO35599 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Opn1mwO35599 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Opn1mwO35599 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Opn1mwO35599 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Opn1mwO35599 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Opn1mwO35599 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Opn1mwO35599 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Opn1mwO35599 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Opn1mwO35599 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Opn1mwO35599 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Opn1mwO35599 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Opn1mwO35599 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Opn1mwO35599 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Opn1mwO35599 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Opn1mwO35599 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Opn1mwO35599 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Opn1mwO35599 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Opn1mwO35599 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Opn1mwO35599 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Opn1mwO35599 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Opn1mwO35599 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Opn1mwO35599 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Opn1mwO35599 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Opn1mwO35599 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Opn1mwO35599 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Opn1mwO35599 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Opn1mwO35599 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Opn1mwO35599 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Opn1mwO35599 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Opn1mwO35599 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
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Opn1mwO35599 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Opn1mwO35599 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Opn1mwO35599 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Opn1mwO35599 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Opn1mwO35599 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Opn1mwO35599 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Opn1mwO35599 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Opn1mwO35599 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Opn1mwO35599 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Opn1mwO35599 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Opn1mwO35599 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Opn1mwO35599 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Opn1mwO35599 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Opn1mwO35599 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Opn1mwO35599 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Opn1mwO35599 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Opn1mwO35599 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Opn1mwO35599 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Opn1mwO35599 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Opn1mwO35599 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Opn1mwO35599 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Opn1mwO35599 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Opn1mwO35599 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Opn1mwO35599 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Opn1mwO35599 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Opn1mwO35599 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Opn1mwO35599 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Opn1mwO35599 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Opn1mwO35599 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Opn1mwO35599 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Opn1mwO35599 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Opn1mwO35599 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Opn1mwO35599 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Opn1mwO35599 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Opn1mwO35599 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Opn1mwO35599 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Opn1mwO35599 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms