Protein–RNA interactions for Protein: O35452

Tnxb, Tenascin X, mousemouse

Predictions only

Length 4,006 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TnxbO35452 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
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TnxbO35452 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TnxbO35452 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TnxbO35452 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TnxbO35452 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TnxbO35452 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TnxbO35452 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TnxbO35452 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TnxbO35452 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TnxbO35452 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TnxbO35452 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TnxbO35452 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TnxbO35452 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TnxbO35452 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
TnxbO35452 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TnxbO35452 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TnxbO35452 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TnxbO35452 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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TnxbO35452 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TnxbO35452 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TnxbO35452 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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TnxbO35452 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TnxbO35452 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TnxbO35452 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TnxbO35452 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TnxbO35452 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TnxbO35452 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TnxbO35452 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TnxbO35452 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TnxbO35452 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TnxbO35452 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
TnxbO35452 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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TnxbO35452 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TnxbO35452 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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TnxbO35452 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TnxbO35452 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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TnxbO35452 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TnxbO35452 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TnxbO35452 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TnxbO35452 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TnxbO35452 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
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TnxbO35452 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TnxbO35452 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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TnxbO35452 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TnxbO35452 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TnxbO35452 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TnxbO35452 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TnxbO35452 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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TnxbO35452 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TnxbO35452 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
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TnxbO35452 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TnxbO35452 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TnxbO35452 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TnxbO35452 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TnxbO35452 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TnxbO35452 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TnxbO35452 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TnxbO35452 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TnxbO35452 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
TnxbO35452 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TnxbO35452 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
TnxbO35452 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
TnxbO35452 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TnxbO35452 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
TnxbO35452 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TnxbO35452 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
TnxbO35452 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
TnxbO35452 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
TnxbO35452 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TnxbO35452 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
TnxbO35452 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TnxbO35452 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TnxbO35452 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
TnxbO35452 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TnxbO35452 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
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TnxbO35452 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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TnxbO35452 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
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