Protein–RNA interactions for Protein: O35173

Kcns1, Potassium voltage-gated channel subfamily S member 1, mousemouse

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Length 497 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcns1O35173 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Kcns1O35173 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Kcns1O35173 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Kcns1O35173 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Kcns1O35173 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Kcns1O35173 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Kcns1O35173 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Kcns1O35173 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Kcns1O35173 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Kcns1O35173 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Kcns1O35173 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Kcns1O35173 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Kcns1O35173 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Kcns1O35173 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Kcns1O35173 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Kcns1O35173 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Kcns1O35173 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Kcns1O35173 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Kcns1O35173 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Kcns1O35173 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Kcns1O35173 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Kcns1O35173 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Kcns1O35173 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Kcns1O35173 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Kcns1O35173 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Kcns1O35173 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Kcns1O35173 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Kcns1O35173 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Kcns1O35173 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Kcns1O35173 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Kcns1O35173 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Kcns1O35173 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Kcns1O35173 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Kcns1O35173 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Kcns1O35173 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Kcns1O35173 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Kcns1O35173 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Kcns1O35173 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Kcns1O35173 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Kcns1O35173 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Kcns1O35173 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Kcns1O35173 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Kcns1O35173 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Kcns1O35173 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Kcns1O35173 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Kcns1O35173 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Kcns1O35173 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Kcns1O35173 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Kcns1O35173 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Kcns1O35173 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Kcns1O35173 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Kcns1O35173 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Kcns1O35173 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Kcns1O35173 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Kcns1O35173 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Kcns1O35173 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Kcns1O35173 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Kcns1O35173 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Kcns1O35173 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Kcns1O35173 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Kcns1O35173 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Kcns1O35173 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
Kcns1O35173 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Kcns1O35173 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Kcns1O35173 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Kcns1O35173 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Kcns1O35173 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Kcns1O35173 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Kcns1O35173 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Kcns1O35173 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Kcns1O35173 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Kcns1O35173 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Kcns1O35173 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Kcns1O35173 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Kcns1O35173 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Kcns1O35173 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Kcns1O35173 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Kcns1O35173 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Kcns1O35173 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Kcns1O35173 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Kcns1O35173 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Kcns1O35173 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Kcns1O35173 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Kcns1O35173 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Kcns1O35173 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Kcns1O35173 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Kcns1O35173 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Kcns1O35173 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Kcns1O35173 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Kcns1O35173 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Kcns1O35173 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Kcns1O35173 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Kcns1O35173 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Kcns1O35173 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Kcns1O35173 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Kcns1O35173 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Kcns1O35173 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Kcns1O35173 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Kcns1O35173 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Kcns1O35173 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms