Protein–RNA interactions for Protein: O35160

Pitx3, Pituitary homeobox 3, mousemouse

Predictions only

Length 302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pitx3O35160 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pitx3O35160 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pitx3O35160 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pitx3O35160 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pitx3O35160 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pitx3O35160 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pitx3O35160 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pitx3O35160 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pitx3O35160 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pitx3O35160 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pitx3O35160 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pitx3O35160 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pitx3O35160 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pitx3O35160 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pitx3O35160 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pitx3O35160 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pitx3O35160 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pitx3O35160 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pitx3O35160 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pitx3O35160 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pitx3O35160 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pitx3O35160 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pitx3O35160 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pitx3O35160 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pitx3O35160 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pitx3O35160 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pitx3O35160 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pitx3O35160 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pitx3O35160 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pitx3O35160 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pitx3O35160 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pitx3O35160 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pitx3O35160 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pitx3O35160 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pitx3O35160 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Pitx3O35160 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Pitx3O35160 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Pitx3O35160 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Pitx3O35160 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Pitx3O35160 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pitx3O35160 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pitx3O35160 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pitx3O35160 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pitx3O35160 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Pitx3O35160 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pitx3O35160 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pitx3O35160 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pitx3O35160 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pitx3O35160 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pitx3O35160 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pitx3O35160 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pitx3O35160 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pitx3O35160 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pitx3O35160 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pitx3O35160 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pitx3O35160 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pitx3O35160 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pitx3O35160 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pitx3O35160 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pitx3O35160 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pitx3O35160 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pitx3O35160 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pitx3O35160 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pitx3O35160 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pitx3O35160 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pitx3O35160 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pitx3O35160 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pitx3O35160 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pitx3O35160 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pitx3O35160 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pitx3O35160 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pitx3O35160 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pitx3O35160 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pitx3O35160 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pitx3O35160 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pitx3O35160 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pitx3O35160 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pitx3O35160 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pitx3O35160 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pitx3O35160 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pitx3O35160 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pitx3O35160 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pitx3O35160 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pitx3O35160 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pitx3O35160 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pitx3O35160 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pitx3O35160 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pitx3O35160 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pitx3O35160 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pitx3O35160 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pitx3O35160 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pitx3O35160 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pitx3O35160 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pitx3O35160 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pitx3O35160 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pitx3O35160 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pitx3O35160 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pitx3O35160 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pitx3O35160 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pitx3O35160 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms