Protein–RNA interactions for Protein: O35054

Cldn4, Claudin-4, mousemouse

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Length 210 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn4O35054 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cldn4O35054 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cldn4O35054 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Cldn4O35054 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Cldn4O35054 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cldn4O35054 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cldn4O35054 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cldn4O35054 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cldn4O35054 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cldn4O35054 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cldn4O35054 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Cldn4O35054 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cldn4O35054 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cldn4O35054 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cldn4O35054 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cldn4O35054 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cldn4O35054 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cldn4O35054 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cldn4O35054 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cldn4O35054 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cldn4O35054 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cldn4O35054 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cldn4O35054 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cldn4O35054 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cldn4O35054 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Cldn4O35054 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Cldn4O35054 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cldn4O35054 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cldn4O35054 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cldn4O35054 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cldn4O35054 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cldn4O35054 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cldn4O35054 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cldn4O35054 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cldn4O35054 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cldn4O35054 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cldn4O35054 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cldn4O35054 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cldn4O35054 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cldn4O35054 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cldn4O35054 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cldn4O35054 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cldn4O35054 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cldn4O35054 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cldn4O35054 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cldn4O35054 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cldn4O35054 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cldn4O35054 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cldn4O35054 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cldn4O35054 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cldn4O35054 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cldn4O35054 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cldn4O35054 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cldn4O35054 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cldn4O35054 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Cldn4O35054 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Cldn4O35054 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cldn4O35054 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cldn4O35054 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cldn4O35054 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cldn4O35054 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cldn4O35054 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cldn4O35054 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cldn4O35054 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cldn4O35054 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cldn4O35054 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cldn4O35054 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cldn4O35054 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cldn4O35054 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cldn4O35054 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cldn4O35054 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cldn4O35054 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cldn4O35054 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cldn4O35054 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cldn4O35054 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Cldn4O35054 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cldn4O35054 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cldn4O35054 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cldn4O35054 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cldn4O35054 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cldn4O35054 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cldn4O35054 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cldn4O35054 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cldn4O35054 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cldn4O35054 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cldn4O35054 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cldn4O35054 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cldn4O35054 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cldn4O35054 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cldn4O35054 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cldn4O35054 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cldn4O35054 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cldn4O35054 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cldn4O35054 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cldn4O35054 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cldn4O35054 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cldn4O35054 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cldn4O35054 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Cldn4O35054 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cldn4O35054 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
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