Protein–RNA interactions for Protein: O08795

Prkcsh, Glucosidase 2 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcshO08795 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PrkcshO08795 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PrkcshO08795 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PrkcshO08795 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PrkcshO08795 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PrkcshO08795 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PrkcshO08795 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PrkcshO08795 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
PrkcshO08795 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PrkcshO08795 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
PrkcshO08795 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PrkcshO08795 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PrkcshO08795 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PrkcshO08795 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PrkcshO08795 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PrkcshO08795 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PrkcshO08795 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PrkcshO08795 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PrkcshO08795 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PrkcshO08795 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PrkcshO08795 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PrkcshO08795 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PrkcshO08795 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PrkcshO08795 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PrkcshO08795 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PrkcshO08795 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PrkcshO08795 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PrkcshO08795 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PrkcshO08795 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PrkcshO08795 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
PrkcshO08795 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PrkcshO08795 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PrkcshO08795 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
PrkcshO08795 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PrkcshO08795 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PrkcshO08795 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PrkcshO08795 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PrkcshO08795 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PrkcshO08795 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PrkcshO08795 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PrkcshO08795 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PrkcshO08795 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PrkcshO08795 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PrkcshO08795 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PrkcshO08795 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PrkcshO08795 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PrkcshO08795 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PrkcshO08795 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PrkcshO08795 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PrkcshO08795 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PrkcshO08795 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PrkcshO08795 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PrkcshO08795 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PrkcshO08795 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PrkcshO08795 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PrkcshO08795 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PrkcshO08795 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PrkcshO08795 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PrkcshO08795 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PrkcshO08795 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PrkcshO08795 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PrkcshO08795 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PrkcshO08795 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PrkcshO08795 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PrkcshO08795 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PrkcshO08795 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PrkcshO08795 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PrkcshO08795 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PrkcshO08795 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PrkcshO08795 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PrkcshO08795 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PrkcshO08795 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PrkcshO08795 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PrkcshO08795 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PrkcshO08795 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PrkcshO08795 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PrkcshO08795 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PrkcshO08795 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PrkcshO08795 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PrkcshO08795 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PrkcshO08795 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PrkcshO08795 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PrkcshO08795 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PrkcshO08795 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PrkcshO08795 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
PrkcshO08795 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PrkcshO08795 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PrkcshO08795 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PrkcshO08795 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PrkcshO08795 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PrkcshO08795 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PrkcshO08795 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PrkcshO08795 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PrkcshO08795 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PrkcshO08795 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PrkcshO08795 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PrkcshO08795 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PrkcshO08795 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PrkcshO08795 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PrkcshO08795 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms