Protein–RNA interactions for Protein: O08790

Fpr-s1, Formyl peptide receptor-related sequence 1, mousemouse

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fpr-s1O08790 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Fpr-s1O08790 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Fpr-s1O08790 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Fpr-s1O08790 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Fpr-s1O08790 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Fpr-s1O08790 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Fpr-s1O08790 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Fpr-s1O08790 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Fpr-s1O08790 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Fpr-s1O08790 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Fpr-s1O08790 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Fpr-s1O08790 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Fpr-s1O08790 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Fpr-s1O08790 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Fpr-s1O08790 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Fpr-s1O08790 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Fpr-s1O08790 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Fpr-s1O08790 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Fpr-s1O08790 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Fpr-s1O08790 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Fpr-s1O08790 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Fpr-s1O08790 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Fpr-s1O08790 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Fpr-s1O08790 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Fpr-s1O08790 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Fpr-s1O08790 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Fpr-s1O08790 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Fpr-s1O08790 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Fpr-s1O08790 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Fpr-s1O08790 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Fpr-s1O08790 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Fpr-s1O08790 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Fpr-s1O08790 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Fpr-s1O08790 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Fpr-s1O08790 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Fpr-s1O08790 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Fpr-s1O08790 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Fpr-s1O08790 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Fpr-s1O08790 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Fpr-s1O08790 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Fpr-s1O08790 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Fpr-s1O08790 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Fpr-s1O08790 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Fpr-s1O08790 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Fpr-s1O08790 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Fpr-s1O08790 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Fpr-s1O08790 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Fpr-s1O08790 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Fpr-s1O08790 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Fpr-s1O08790 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Fpr-s1O08790 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Fpr-s1O08790 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Fpr-s1O08790 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Fpr-s1O08790 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Fpr-s1O08790 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Fpr-s1O08790 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Fpr-s1O08790 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Fpr-s1O08790 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Fpr-s1O08790 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Fpr-s1O08790 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Fpr-s1O08790 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Fpr-s1O08790 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Fpr-s1O08790 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Fpr-s1O08790 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Fpr-s1O08790 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Fpr-s1O08790 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Fpr-s1O08790 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Fpr-s1O08790 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Fpr-s1O08790 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Fpr-s1O08790 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Fpr-s1O08790 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Fpr-s1O08790 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Fpr-s1O08790 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Fpr-s1O08790 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Fpr-s1O08790 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Fpr-s1O08790 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Fpr-s1O08790 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Fpr-s1O08790 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Fpr-s1O08790 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Fpr-s1O08790 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Fpr-s1O08790 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Fpr-s1O08790 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Fpr-s1O08790 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Fpr-s1O08790 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Fpr-s1O08790 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Fpr-s1O08790 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Fpr-s1O08790 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Fpr-s1O08790 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Fpr-s1O08790 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Fpr-s1O08790 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Fpr-s1O08790 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Fpr-s1O08790 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Fpr-s1O08790 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Fpr-s1O08790 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Fpr-s1O08790 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Fpr-s1O08790 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Fpr-s1O08790 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Fpr-s1O08790 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Fpr-s1O08790 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Fpr-s1O08790 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms