Protein–RNA interactions for Protein: O08585

Clta, Clathrin light chain A, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CltaO08585 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CltaO08585 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CltaO08585 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CltaO08585 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CltaO08585 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CltaO08585 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CltaO08585 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CltaO08585 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CltaO08585 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CltaO08585 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CltaO08585 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CltaO08585 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CltaO08585 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CltaO08585 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CltaO08585 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CltaO08585 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CltaO08585 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CltaO08585 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CltaO08585 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CltaO08585 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CltaO08585 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CltaO08585 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
CltaO08585 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CltaO08585 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CltaO08585 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CltaO08585 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CltaO08585 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CltaO08585 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CltaO08585 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CltaO08585 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CltaO08585 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CltaO08585 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CltaO08585 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CltaO08585 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CltaO08585 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CltaO08585 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CltaO08585 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CltaO08585 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CltaO08585 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CltaO08585 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CltaO08585 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
CltaO08585 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CltaO08585 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CltaO08585 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CltaO08585 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CltaO08585 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CltaO08585 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CltaO08585 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CltaO08585 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CltaO08585 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CltaO08585 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CltaO08585 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CltaO08585 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CltaO08585 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CltaO08585 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CltaO08585 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CltaO08585 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CltaO08585 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
CltaO08585 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CltaO08585 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CltaO08585 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CltaO08585 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
CltaO08585 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CltaO08585 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CltaO08585 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CltaO08585 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
CltaO08585 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CltaO08585 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CltaO08585 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
CltaO08585 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CltaO08585 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CltaO08585 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CltaO08585 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CltaO08585 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CltaO08585 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CltaO08585 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CltaO08585 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CltaO08585 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CltaO08585 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CltaO08585 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CltaO08585 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CltaO08585 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
CltaO08585 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CltaO08585 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CltaO08585 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CltaO08585 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CltaO08585 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CltaO08585 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CltaO08585 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CltaO08585 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
CltaO08585 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CltaO08585 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CltaO08585 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CltaO08585 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CltaO08585 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CltaO08585 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CltaO08585 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CltaO08585 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CltaO08585 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CltaO08585 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.9 ms