Protein–RNA interactions for Protein: L7N2C9

Vmn1r117, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r117L7N2C9 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r117L7N2C9 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn1r117L7N2C9 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn1r117L7N2C9 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn1r117L7N2C9 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn1r117L7N2C9 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn1r117L7N2C9 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn1r117L7N2C9 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn1r117L7N2C9 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn1r117L7N2C9 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn1r117L7N2C9 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn1r117L7N2C9 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn1r117L7N2C9 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn1r117L7N2C9 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn1r117L7N2C9 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r117L7N2C9 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r117L7N2C9 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r117L7N2C9 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r117L7N2C9 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r117L7N2C9 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r117L7N2C9 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r117L7N2C9 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r117L7N2C9 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r117L7N2C9 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r117L7N2C9 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r117L7N2C9 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r117L7N2C9 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r117L7N2C9 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r117L7N2C9 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r117L7N2C9 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r117L7N2C9 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r117L7N2C9 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r117L7N2C9 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r117L7N2C9 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r117L7N2C9 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r117L7N2C9 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r117L7N2C9 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r117L7N2C9 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r117L7N2C9 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r117L7N2C9 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r117L7N2C9 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r117L7N2C9 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r117L7N2C9 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r117L7N2C9 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r117L7N2C9 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r117L7N2C9 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vmn1r117L7N2C9 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vmn1r117L7N2C9 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vmn1r117L7N2C9 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vmn1r117L7N2C9 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vmn1r117L7N2C9 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vmn1r117L7N2C9 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vmn1r117L7N2C9 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vmn1r117L7N2C9 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vmn1r117L7N2C9 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Vmn1r117L7N2C9 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Vmn1r117L7N2C9 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Vmn1r117L7N2C9 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Vmn1r117L7N2C9 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Vmn1r117L7N2C9 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r117L7N2C9 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r117L7N2C9 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r117L7N2C9 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r117L7N2C9 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r117L7N2C9 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r117L7N2C9 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r117L7N2C9 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r117L7N2C9 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vmn1r117L7N2C9 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vmn1r117L7N2C9 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Vmn1r117L7N2C9 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Vmn1r117L7N2C9 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vmn1r117L7N2C9 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Vmn1r117L7N2C9 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vmn1r117L7N2C9 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Vmn1r117L7N2C9 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC16■□□□□ 0.15
Vmn1r117L7N2C9 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vmn1r117L7N2C9 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Vmn1r117L7N2C9 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Vmn1r117L7N2C9 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Vmn1r117L7N2C9 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r117L7N2C9 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r117L7N2C9 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r117L7N2C9 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r117L7N2C9 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r117L7N2C9 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r117L7N2C9 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r117L7N2C9 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r117L7N2C9 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r117L7N2C9 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r117L7N2C9 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn1r117L7N2C9 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn1r117L7N2C9 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn1r117L7N2C9 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn1r117L7N2C9 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn1r117L7N2C9 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn1r117L7N2C9 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn1r117L7N2C9 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn1r117L7N2C9 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn1r117L7N2C9 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms