Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ02

Gm2056, Predicted gene 2056, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2056J3QQ02 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gm2056J3QQ02 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gm2056J3QQ02 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gm2056J3QQ02 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gm2056J3QQ02 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gm2056J3QQ02 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gm2056J3QQ02 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gm2056J3QQ02 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gm2056J3QQ02 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gm2056J3QQ02 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gm2056J3QQ02 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gm2056J3QQ02 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gm2056J3QQ02 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gm2056J3QQ02 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gm2056J3QQ02 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gm2056J3QQ02 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gm2056J3QQ02 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gm2056J3QQ02 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gm2056J3QQ02 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gm2056J3QQ02 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gm2056J3QQ02 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gm2056J3QQ02 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Gm2056J3QQ02 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gm2056J3QQ02 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gm2056J3QQ02 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gm2056J3QQ02 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gm2056J3QQ02 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gm2056J3QQ02 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gm2056J3QQ02 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gm2056J3QQ02 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gm2056J3QQ02 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gm2056J3QQ02 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gm2056J3QQ02 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gm2056J3QQ02 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gm2056J3QQ02 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gm2056J3QQ02 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gm2056J3QQ02 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gm2056J3QQ02 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gm2056J3QQ02 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gm2056J3QQ02 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gm2056J3QQ02 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gm2056J3QQ02 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gm2056J3QQ02 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gm2056J3QQ02 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gm2056J3QQ02 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gm2056J3QQ02 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gm2056J3QQ02 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gm2056J3QQ02 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gm2056J3QQ02 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gm2056J3QQ02 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gm2056J3QQ02 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gm2056J3QQ02 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gm2056J3QQ02 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gm2056J3QQ02 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gm2056J3QQ02 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gm2056J3QQ02 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gm2056J3QQ02 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gm2056J3QQ02 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gm2056J3QQ02 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gm2056J3QQ02 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gm2056J3QQ02 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gm2056J3QQ02 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gm2056J3QQ02 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gm2056J3QQ02 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gm2056J3QQ02 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gm2056J3QQ02 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gm2056J3QQ02 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gm2056J3QQ02 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gm2056J3QQ02 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gm2056J3QQ02 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gm2056J3QQ02 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Gm2056J3QQ02 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gm2056J3QQ02 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gm2056J3QQ02 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gm2056J3QQ02 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gm2056J3QQ02 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gm2056J3QQ02 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gm2056J3QQ02 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gm2056J3QQ02 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gm2056J3QQ02 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gm2056J3QQ02 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gm2056J3QQ02 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Gm2056J3QQ02 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gm2056J3QQ02 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gm2056J3QQ02 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gm2056J3QQ02 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gm2056J3QQ02 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gm2056J3QQ02 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gm2056J3QQ02 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gm2056J3QQ02 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gm2056J3QQ02 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gm2056J3QQ02 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gm2056J3QQ02 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gm2056J3QQ02 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gm2056J3QQ02 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gm2056J3QQ02 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gm2056J3QQ02 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gm2056J3QQ02 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gm2056J3QQ02 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gm2056J3QQ02 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.8 ms