Protein–RNA interactions for Protein: J3QPC1

Gm933, Predicted gene 933, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm933J3QPC1 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm933J3QPC1 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm933J3QPC1 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm933J3QPC1 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm933J3QPC1 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm933J3QPC1 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm933J3QPC1 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm933J3QPC1 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm933J3QPC1 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm933J3QPC1 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm933J3QPC1 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm933J3QPC1 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm933J3QPC1 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm933J3QPC1 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm933J3QPC1 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm933J3QPC1 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm933J3QPC1 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm933J3QPC1 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm933J3QPC1 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm933J3QPC1 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm933J3QPC1 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm933J3QPC1 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm933J3QPC1 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm933J3QPC1 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm933J3QPC1 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm933J3QPC1 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm933J3QPC1 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm933J3QPC1 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm933J3QPC1 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm933J3QPC1 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gm933J3QPC1 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gm933J3QPC1 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gm933J3QPC1 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gm933J3QPC1 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm933J3QPC1 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm933J3QPC1 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm933J3QPC1 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm933J3QPC1 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm933J3QPC1 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm933J3QPC1 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm933J3QPC1 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm933J3QPC1 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm933J3QPC1 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm933J3QPC1 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm933J3QPC1 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm933J3QPC1 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm933J3QPC1 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm933J3QPC1 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm933J3QPC1 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm933J3QPC1 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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Gm933J3QPC1 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm933J3QPC1 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm933J3QPC1 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm933J3QPC1 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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Gm933J3QPC1 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm933J3QPC1 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm933J3QPC1 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm933J3QPC1 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm933J3QPC1 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm933J3QPC1 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm933J3QPC1 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm933J3QPC1 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm933J3QPC1 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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Gm933J3QPC1 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm933J3QPC1 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm933J3QPC1 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm933J3QPC1 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm933J3QPC1 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm933J3QPC1 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm933J3QPC1 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
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Gm933J3QPC1 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm933J3QPC1 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm933J3QPC1 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm933J3QPC1 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm933J3QPC1 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm933J3QPC1 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm933J3QPC1 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm933J3QPC1 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm933J3QPC1 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm933J3QPC1 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm933J3QPC1 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm933J3QPC1 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm933J3QPC1 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm933J3QPC1 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm933J3QPC1 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm933J3QPC1 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm933J3QPC1 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm933J3QPC1 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm933J3QPC1 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm933J3QPC1 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm933J3QPC1 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm933J3QPC1 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm933J3QPC1 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm933J3QPC1 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms