Protein–RNA interactions for Protein: J3QP87

Gm2035, Predicted pseudogene 2035, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2035J3QP87 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm2035J3QP87 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm2035J3QP87 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm2035J3QP87 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm2035J3QP87 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm2035J3QP87 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm2035J3QP87 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm2035J3QP87 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm2035J3QP87 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm2035J3QP87 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm2035J3QP87 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm2035J3QP87 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm2035J3QP87 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm2035J3QP87 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm2035J3QP87 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm2035J3QP87 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm2035J3QP87 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm2035J3QP87 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm2035J3QP87 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm2035J3QP87 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm2035J3QP87 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm2035J3QP87 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm2035J3QP87 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm2035J3QP87 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm2035J3QP87 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm2035J3QP87 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm2035J3QP87 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm2035J3QP87 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm2035J3QP87 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm2035J3QP87 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm2035J3QP87 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gm2035J3QP87 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gm2035J3QP87 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gm2035J3QP87 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gm2035J3QP87 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gm2035J3QP87 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gm2035J3QP87 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm2035J3QP87 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm2035J3QP87 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm2035J3QP87 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm2035J3QP87 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm2035J3QP87 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm2035J3QP87 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
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Gm2035J3QP87 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm2035J3QP87 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
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Gm2035J3QP87 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm2035J3QP87 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm2035J3QP87 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm2035J3QP87 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm2035J3QP87 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm2035J3QP87 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm2035J3QP87 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Gm2035J3QP87 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm2035J3QP87 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm2035J3QP87 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm2035J3QP87 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm2035J3QP87 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
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Gm2035J3QP87 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
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Gm2035J3QP87 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm2035J3QP87 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm2035J3QP87 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm2035J3QP87 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
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Gm2035J3QP87 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm2035J3QP87 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm2035J3QP87 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm2035J3QP87 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm2035J3QP87 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm2035J3QP87 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm2035J3QP87 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm2035J3QP87 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm2035J3QP87 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm2035J3QP87 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm2035J3QP87 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm2035J3QP87 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm2035J3QP87 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm2035J3QP87 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm2035J3QP87 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm2035J3QP87 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm2035J3QP87 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm2035J3QP87 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm2035J3QP87 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm2035J3QP87 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm2035J3QP87 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm2035J3QP87 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm2035J3QP87 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm2035J3QP87 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm2035J3QP87 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm2035J3QP87 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm2035J3QP87 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm2035J3QP87 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm2035J3QP87 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
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