Protein–RNA interactions for Protein: J3QMA2

Gm28051, Predicted gene, 28051, mousemouse

Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28051J3QMA2 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm28051J3QMA2 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm28051J3QMA2 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm28051J3QMA2 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm28051J3QMA2 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm28051J3QMA2 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm28051J3QMA2 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm28051J3QMA2 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm28051J3QMA2 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm28051J3QMA2 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm28051J3QMA2 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm28051J3QMA2 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm28051J3QMA2 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm28051J3QMA2 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm28051J3QMA2 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm28051J3QMA2 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm28051J3QMA2 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm28051J3QMA2 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm28051J3QMA2 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm28051J3QMA2 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm28051J3QMA2 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm28051J3QMA2 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm28051J3QMA2 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm28051J3QMA2 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm28051J3QMA2 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm28051J3QMA2 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm28051J3QMA2 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm28051J3QMA2 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm28051J3QMA2 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm28051J3QMA2 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm28051J3QMA2 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm28051J3QMA2 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm28051J3QMA2 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm28051J3QMA2 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm28051J3QMA2 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm28051J3QMA2 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm28051J3QMA2 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm28051J3QMA2 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm28051J3QMA2 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm28051J3QMA2 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm28051J3QMA2 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm28051J3QMA2 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm28051J3QMA2 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm28051J3QMA2 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm28051J3QMA2 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm28051J3QMA2 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm28051J3QMA2 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm28051J3QMA2 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm28051J3QMA2 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm28051J3QMA2 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm28051J3QMA2 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm28051J3QMA2 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm28051J3QMA2 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm28051J3QMA2 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm28051J3QMA2 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm28051J3QMA2 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm28051J3QMA2 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm28051J3QMA2 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm28051J3QMA2 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm28051J3QMA2 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm28051J3QMA2 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm28051J3QMA2 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm28051J3QMA2 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm28051J3QMA2 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm28051J3QMA2 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm28051J3QMA2 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm28051J3QMA2 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm28051J3QMA2 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm28051J3QMA2 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm28051J3QMA2 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm28051J3QMA2 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm28051J3QMA2 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm28051J3QMA2 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm28051J3QMA2 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm28051J3QMA2 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm28051J3QMA2 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm28051J3QMA2 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm28051J3QMA2 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm28051J3QMA2 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm28051J3QMA2 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm28051J3QMA2 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm28051J3QMA2 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm28051J3QMA2 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm28051J3QMA2 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm28051J3QMA2 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm28051J3QMA2 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm28051J3QMA2 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm28051J3QMA2 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm28051J3QMA2 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm28051J3QMA2 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm28051J3QMA2 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm28051J3QMA2 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm28051J3QMA2 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm28051J3QMA2 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm28051J3QMA2 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm28051J3QMA2 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm28051J3QMA2 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm28051J3QMA2 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm28051J3QMA2 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm28051J3QMA2 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms