Protein–RNA interactions for Protein: J3KMU2

Gm21820, Predicted gene, 21820, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21820J3KMU2 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm21820J3KMU2 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm21820J3KMU2 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm21820J3KMU2 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm21820J3KMU2 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm21820J3KMU2 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm21820J3KMU2 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm21820J3KMU2 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm21820J3KMU2 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm21820J3KMU2 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm21820J3KMU2 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm21820J3KMU2 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm21820J3KMU2 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm21820J3KMU2 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm21820J3KMU2 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm21820J3KMU2 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm21820J3KMU2 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm21820J3KMU2 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm21820J3KMU2 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm21820J3KMU2 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm21820J3KMU2 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm21820J3KMU2 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm21820J3KMU2 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm21820J3KMU2 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm21820J3KMU2 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm21820J3KMU2 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm21820J3KMU2 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm21820J3KMU2 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm21820J3KMU2 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm21820J3KMU2 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm21820J3KMU2 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm21820J3KMU2 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gm21820J3KMU2 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gm21820J3KMU2 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gm21820J3KMU2 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gm21820J3KMU2 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gm21820J3KMU2 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Gm21820J3KMU2 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gm21820J3KMU2 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gm21820J3KMU2 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gm21820J3KMU2 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Gm21820J3KMU2 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gm21820J3KMU2 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm21820J3KMU2 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm21820J3KMU2 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm21820J3KMU2 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm21820J3KMU2 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm21820J3KMU2 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm21820J3KMU2 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm21820J3KMU2 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm21820J3KMU2 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm21820J3KMU2 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm21820J3KMU2 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm21820J3KMU2 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gm21820J3KMU2 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gm21820J3KMU2 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gm21820J3KMU2 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gm21820J3KMU2 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gm21820J3KMU2 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gm21820J3KMU2 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gm21820J3KMU2 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gm21820J3KMU2 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gm21820J3KMU2 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gm21820J3KMU2 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Gm21820J3KMU2 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Gm21820J3KMU2 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Gm21820J3KMU2 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Gm21820J3KMU2 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gm21820J3KMU2 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gm21820J3KMU2 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gm21820J3KMU2 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gm21820J3KMU2 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gm21820J3KMU2 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gm21820J3KMU2 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gm21820J3KMU2 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gm21820J3KMU2 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gm21820J3KMU2 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gm21820J3KMU2 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gm21820J3KMU2 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gm21820J3KMU2 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gm21820J3KMU2 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gm21820J3KMU2 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gm21820J3KMU2 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gm21820J3KMU2 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gm21820J3KMU2 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gm21820J3KMU2 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gm21820J3KMU2 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gm21820J3KMU2 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gm21820J3KMU2 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gm21820J3KMU2 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gm21820J3KMU2 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gm21820J3KMU2 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gm21820J3KMU2 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gm21820J3KMU2 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gm21820J3KMU2 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gm21820J3KMU2 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gm21820J3KMU2 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gm21820J3KMU2 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gm21820J3KMU2 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gm21820J3KMU2 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
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