Protein–RNA interactions for Protein: I3ITR1

AK157302, MCG50313, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AK157302I3ITR1 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
AK157302I3ITR1 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
AK157302I3ITR1 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
AK157302I3ITR1 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
AK157302I3ITR1 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
AK157302I3ITR1 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
AK157302I3ITR1 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
AK157302I3ITR1 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
AK157302I3ITR1 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
AK157302I3ITR1 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
AK157302I3ITR1 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
AK157302I3ITR1 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
AK157302I3ITR1 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
AK157302I3ITR1 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
AK157302I3ITR1 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
AK157302I3ITR1 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
AK157302I3ITR1 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
AK157302I3ITR1 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
AK157302I3ITR1 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
AK157302I3ITR1 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
AK157302I3ITR1 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
AK157302I3ITR1 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
AK157302I3ITR1 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
AK157302I3ITR1 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
AK157302I3ITR1 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
AK157302I3ITR1 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
AK157302I3ITR1 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
AK157302I3ITR1 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
AK157302I3ITR1 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
AK157302I3ITR1 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
AK157302I3ITR1 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
AK157302I3ITR1 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
AK157302I3ITR1 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
AK157302I3ITR1 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
AK157302I3ITR1 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
AK157302I3ITR1 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
AK157302I3ITR1 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
AK157302I3ITR1 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
AK157302I3ITR1 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
AK157302I3ITR1 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
AK157302I3ITR1 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
AK157302I3ITR1 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
AK157302I3ITR1 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
AK157302I3ITR1 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
AK157302I3ITR1 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
AK157302I3ITR1 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
AK157302I3ITR1 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
AK157302I3ITR1 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
AK157302I3ITR1 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
AK157302I3ITR1 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
AK157302I3ITR1 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
AK157302I3ITR1 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
AK157302I3ITR1 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
AK157302I3ITR1 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
AK157302I3ITR1 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
AK157302I3ITR1 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
AK157302I3ITR1 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
AK157302I3ITR1 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
AK157302I3ITR1 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
AK157302I3ITR1 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
AK157302I3ITR1 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
AK157302I3ITR1 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
AK157302I3ITR1 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
AK157302I3ITR1 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
AK157302I3ITR1 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
AK157302I3ITR1 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
AK157302I3ITR1 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
AK157302I3ITR1 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
AK157302I3ITR1 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
AK157302I3ITR1 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
AK157302I3ITR1 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
AK157302I3ITR1 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
AK157302I3ITR1 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
AK157302I3ITR1 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
AK157302I3ITR1 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
AK157302I3ITR1 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
AK157302I3ITR1 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
AK157302I3ITR1 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
AK157302I3ITR1 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
AK157302I3ITR1 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
AK157302I3ITR1 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
AK157302I3ITR1 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
AK157302I3ITR1 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
AK157302I3ITR1 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
AK157302I3ITR1 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
AK157302I3ITR1 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
AK157302I3ITR1 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
AK157302I3ITR1 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
AK157302I3ITR1 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
AK157302I3ITR1 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
AK157302I3ITR1 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
AK157302I3ITR1 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
AK157302I3ITR1 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
AK157302I3ITR1 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
AK157302I3ITR1 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
AK157302I3ITR1 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
AK157302I3ITR1 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
AK157302I3ITR1 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
AK157302I3ITR1 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
AK157302I3ITR1 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms