Protein–RNA interactions for Protein: G5E8I7

Usp17lc, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein C, mousemouse

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Length 545 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp17lcG5E8I7 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Usp17lcG5E8I7 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Usp17lcG5E8I7 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Usp17lcG5E8I7 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Usp17lcG5E8I7 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Usp17lcG5E8I7 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Usp17lcG5E8I7 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Usp17lcG5E8I7 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Usp17lcG5E8I7 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Usp17lcG5E8I7 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Usp17lcG5E8I7 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Usp17lcG5E8I7 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Usp17lcG5E8I7 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Usp17lcG5E8I7 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Usp17lcG5E8I7 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Usp17lcG5E8I7 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Usp17lcG5E8I7 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Usp17lcG5E8I7 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Usp17lcG5E8I7 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Usp17lcG5E8I7 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Usp17lcG5E8I7 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Usp17lcG5E8I7 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Usp17lcG5E8I7 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Usp17lcG5E8I7 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Usp17lcG5E8I7 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Usp17lcG5E8I7 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Usp17lcG5E8I7 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Usp17lcG5E8I7 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Usp17lcG5E8I7 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Usp17lcG5E8I7 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Usp17lcG5E8I7 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Usp17lcG5E8I7 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Usp17lcG5E8I7 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Usp17lcG5E8I7 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Usp17lcG5E8I7 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Usp17lcG5E8I7 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Usp17lcG5E8I7 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Usp17lcG5E8I7 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Usp17lcG5E8I7 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Usp17lcG5E8I7 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Usp17lcG5E8I7 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Usp17lcG5E8I7 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Usp17lcG5E8I7 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Usp17lcG5E8I7 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Usp17lcG5E8I7 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Usp17lcG5E8I7 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Usp17lcG5E8I7 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Usp17lcG5E8I7 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Usp17lcG5E8I7 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Usp17lcG5E8I7 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Usp17lcG5E8I7 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Usp17lcG5E8I7 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Usp17lcG5E8I7 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Usp17lcG5E8I7 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Usp17lcG5E8I7 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Usp17lcG5E8I7 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Usp17lcG5E8I7 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Usp17lcG5E8I7 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Usp17lcG5E8I7 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Usp17lcG5E8I7 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Usp17lcG5E8I7 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Usp17lcG5E8I7 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Usp17lcG5E8I7 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Usp17lcG5E8I7 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Usp17lcG5E8I7 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Usp17lcG5E8I7 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Usp17lcG5E8I7 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Usp17lcG5E8I7 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Usp17lcG5E8I7 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Usp17lcG5E8I7 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Usp17lcG5E8I7 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Usp17lcG5E8I7 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Usp17lcG5E8I7 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Usp17lcG5E8I7 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Usp17lcG5E8I7 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Usp17lcG5E8I7 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Usp17lcG5E8I7 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Usp17lcG5E8I7 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Usp17lcG5E8I7 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Usp17lcG5E8I7 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Usp17lcG5E8I7 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Usp17lcG5E8I7 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Usp17lcG5E8I7 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Usp17lcG5E8I7 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Usp17lcG5E8I7 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Usp17lcG5E8I7 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Usp17lcG5E8I7 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Usp17lcG5E8I7 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Usp17lcG5E8I7 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Usp17lcG5E8I7 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Usp17lcG5E8I7 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Usp17lcG5E8I7 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Usp17lcG5E8I7 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Usp17lcG5E8I7 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Usp17lcG5E8I7 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Usp17lcG5E8I7 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Usp17lcG5E8I7 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Usp17lcG5E8I7 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Usp17lcG5E8I7 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Usp17lcG5E8I7 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
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