Protein–RNA interactions for Protein: G5E8C1

Vmn1r67, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r67G5E8C1 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Vmn1r67G5E8C1 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Vmn1r67G5E8C1 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Vmn1r67G5E8C1 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Vmn1r67G5E8C1 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Vmn1r67G5E8C1 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Vmn1r67G5E8C1 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Vmn1r67G5E8C1 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Vmn1r67G5E8C1 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Vmn1r67G5E8C1 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Vmn1r67G5E8C1 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Vmn1r67G5E8C1 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Vmn1r67G5E8C1 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Vmn1r67G5E8C1 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Vmn1r67G5E8C1 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Vmn1r67G5E8C1 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Vmn1r67G5E8C1 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Vmn1r67G5E8C1 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Vmn1r67G5E8C1 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Vmn1r67G5E8C1 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Vmn1r67G5E8C1 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Vmn1r67G5E8C1 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Vmn1r67G5E8C1 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Vmn1r67G5E8C1 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Vmn1r67G5E8C1 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Vmn1r67G5E8C1 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Vmn1r67G5E8C1 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Vmn1r67G5E8C1 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Vmn1r67G5E8C1 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Vmn1r67G5E8C1 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Vmn1r67G5E8C1 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Vmn1r67G5E8C1 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Vmn1r67G5E8C1 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Vmn1r67G5E8C1 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Vmn1r67G5E8C1 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Vmn1r67G5E8C1 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Vmn1r67G5E8C1 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Vmn1r67G5E8C1 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Vmn1r67G5E8C1 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Vmn1r67G5E8C1 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Vmn1r67G5E8C1 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Vmn1r67G5E8C1 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Vmn1r67G5E8C1 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Vmn1r67G5E8C1 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Vmn1r67G5E8C1 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Vmn1r67G5E8C1 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Vmn1r67G5E8C1 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Vmn1r67G5E8C1 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Vmn1r67G5E8C1 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Vmn1r67G5E8C1 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Vmn1r67G5E8C1 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Vmn1r67G5E8C1 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Vmn1r67G5E8C1 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Vmn1r67G5E8C1 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Vmn1r67G5E8C1 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Vmn1r67G5E8C1 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Vmn1r67G5E8C1 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Vmn1r67G5E8C1 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Vmn1r67G5E8C1 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Vmn1r67G5E8C1 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Vmn1r67G5E8C1 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Vmn1r67G5E8C1 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Vmn1r67G5E8C1 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Vmn1r67G5E8C1 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Vmn1r67G5E8C1 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Vmn1r67G5E8C1 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Vmn1r67G5E8C1 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Vmn1r67G5E8C1 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Vmn1r67G5E8C1 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Vmn1r67G5E8C1 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Vmn1r67G5E8C1 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Vmn1r67G5E8C1 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Vmn1r67G5E8C1 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Vmn1r67G5E8C1 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Vmn1r67G5E8C1 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Vmn1r67G5E8C1 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Vmn1r67G5E8C1 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Vmn1r67G5E8C1 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Vmn1r67G5E8C1 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Vmn1r67G5E8C1 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Vmn1r67G5E8C1 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Vmn1r67G5E8C1 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Vmn1r67G5E8C1 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Vmn1r67G5E8C1 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Vmn1r67G5E8C1 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Vmn1r67G5E8C1 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Vmn1r67G5E8C1 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Vmn1r67G5E8C1 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Vmn1r67G5E8C1 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Vmn1r67G5E8C1 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Vmn1r67G5E8C1 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Vmn1r67G5E8C1 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Vmn1r67G5E8C1 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Vmn1r67G5E8C1 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Vmn1r67G5E8C1 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Vmn1r67G5E8C1 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Vmn1r67G5E8C1 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Vmn1r67G5E8C1 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Vmn1r67G5E8C1 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Vmn1r67G5E8C1 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 114.3 ms