Protein–RNA interactions for Protein: G5E829

Atp2b1, Plasma membrane calcium-transporting ATPase 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp2b1G5E829 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Atp2b1G5E829 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Atp2b1G5E829 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Atp2b1G5E829 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Atp2b1G5E829 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Atp2b1G5E829 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Atp2b1G5E829 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Atp2b1G5E829 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Atp2b1G5E829 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Atp2b1G5E829 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Atp2b1G5E829 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Atp2b1G5E829 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Atp2b1G5E829 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Atp2b1G5E829 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Atp2b1G5E829 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Atp2b1G5E829 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Atp2b1G5E829 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Atp2b1G5E829 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Atp2b1G5E829 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Atp2b1G5E829 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Atp2b1G5E829 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Atp2b1G5E829 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Atp2b1G5E829 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Atp2b1G5E829 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Atp2b1G5E829 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Atp2b1G5E829 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Atp2b1G5E829 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Atp2b1G5E829 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Atp2b1G5E829 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Atp2b1G5E829 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Atp2b1G5E829 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Atp2b1G5E829 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Atp2b1G5E829 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Atp2b1G5E829 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Atp2b1G5E829 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Atp2b1G5E829 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Atp2b1G5E829 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Atp2b1G5E829 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Atp2b1G5E829 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Atp2b1G5E829 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Atp2b1G5E829 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Atp2b1G5E829 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Atp2b1G5E829 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Atp2b1G5E829 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Atp2b1G5E829 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Atp2b1G5E829 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Atp2b1G5E829 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Atp2b1G5E829 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Atp2b1G5E829 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Atp2b1G5E829 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Atp2b1G5E829 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Atp2b1G5E829 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Atp2b1G5E829 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Atp2b1G5E829 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Atp2b1G5E829 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Atp2b1G5E829 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Atp2b1G5E829 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Atp2b1G5E829 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Atp2b1G5E829 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Atp2b1G5E829 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Atp2b1G5E829 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Atp2b1G5E829 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Atp2b1G5E829 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Atp2b1G5E829 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Atp2b1G5E829 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Atp2b1G5E829 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Atp2b1G5E829 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Atp2b1G5E829 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Atp2b1G5E829 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Atp2b1G5E829 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Atp2b1G5E829 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Atp2b1G5E829 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Atp2b1G5E829 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Atp2b1G5E829 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Atp2b1G5E829 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Atp2b1G5E829 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Atp2b1G5E829 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Atp2b1G5E829 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Atp2b1G5E829 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Atp2b1G5E829 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Atp2b1G5E829 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Atp2b1G5E829 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Atp2b1G5E829 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Atp2b1G5E829 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Atp2b1G5E829 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Atp2b1G5E829 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Atp2b1G5E829 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Atp2b1G5E829 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Atp2b1G5E829 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Atp2b1G5E829 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Atp2b1G5E829 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Atp2b1G5E829 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Atp2b1G5E829 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Atp2b1G5E829 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Atp2b1G5E829 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Atp2b1G5E829 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Atp2b1G5E829 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Atp2b1G5E829 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Atp2b1G5E829 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Atp2b1G5E829 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms