Protein–RNA interactions for Protein: G3XA52

Vmn1r34, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 309 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r34G3XA52 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Vmn1r34G3XA52 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Vmn1r34G3XA52 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Vmn1r34G3XA52 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Vmn1r34G3XA52 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Vmn1r34G3XA52 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Vmn1r34G3XA52 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Vmn1r34G3XA52 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Vmn1r34G3XA52 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Vmn1r34G3XA52 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Vmn1r34G3XA52 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Vmn1r34G3XA52 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Vmn1r34G3XA52 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Vmn1r34G3XA52 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Vmn1r34G3XA52 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Vmn1r34G3XA52 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Vmn1r34G3XA52 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Vmn1r34G3XA52 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Vmn1r34G3XA52 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Vmn1r34G3XA52 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Vmn1r34G3XA52 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Vmn1r34G3XA52 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Vmn1r34G3XA52 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Vmn1r34G3XA52 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Vmn1r34G3XA52 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Vmn1r34G3XA52 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Vmn1r34G3XA52 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Vmn1r34G3XA52 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Vmn1r34G3XA52 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Vmn1r34G3XA52 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Vmn1r34G3XA52 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Vmn1r34G3XA52 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Vmn1r34G3XA52 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Vmn1r34G3XA52 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Vmn1r34G3XA52 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Vmn1r34G3XA52 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Vmn1r34G3XA52 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Vmn1r34G3XA52 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Vmn1r34G3XA52 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Vmn1r34G3XA52 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Vmn1r34G3XA52 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Vmn1r34G3XA52 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Vmn1r34G3XA52 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Vmn1r34G3XA52 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Vmn1r34G3XA52 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Vmn1r34G3XA52 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Vmn1r34G3XA52 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Vmn1r34G3XA52 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Vmn1r34G3XA52 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Vmn1r34G3XA52 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Vmn1r34G3XA52 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Vmn1r34G3XA52 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Vmn1r34G3XA52 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Vmn1r34G3XA52 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Vmn1r34G3XA52 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Vmn1r34G3XA52 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Vmn1r34G3XA52 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Vmn1r34G3XA52 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Vmn1r34G3XA52 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Vmn1r34G3XA52 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Vmn1r34G3XA52 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Vmn1r34G3XA52 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Vmn1r34G3XA52 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Vmn1r34G3XA52 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Vmn1r34G3XA52 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Vmn1r34G3XA52 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Vmn1r34G3XA52 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Vmn1r34G3XA52 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Vmn1r34G3XA52 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Vmn1r34G3XA52 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Vmn1r34G3XA52 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Vmn1r34G3XA52 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Vmn1r34G3XA52 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Vmn1r34G3XA52 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Vmn1r34G3XA52 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Vmn1r34G3XA52 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Vmn1r34G3XA52 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Vmn1r34G3XA52 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Vmn1r34G3XA52 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Vmn1r34G3XA52 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Vmn1r34G3XA52 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Vmn1r34G3XA52 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Vmn1r34G3XA52 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Vmn1r34G3XA52 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Vmn1r34G3XA52 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Vmn1r34G3XA52 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Vmn1r34G3XA52 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Vmn1r34G3XA52 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Vmn1r34G3XA52 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Vmn1r34G3XA52 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Vmn1r34G3XA52 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Vmn1r34G3XA52 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Vmn1r34G3XA52 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Vmn1r34G3XA52 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Vmn1r34G3XA52 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Vmn1r34G3XA52 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Vmn1r34G3XA52 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Vmn1r34G3XA52 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Vmn1r34G3XA52 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Vmn1r34G3XA52 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.8 ms