Protein–RNA interactions for Protein: G3X9I7

Zc3h12b, MCG2522, mousemouse

Predictions only

Length 835 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zc3h12bG3X9I7 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Zc3h12bG3X9I7 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Zc3h12bG3X9I7 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Zc3h12bG3X9I7 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Zc3h12bG3X9I7 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Zc3h12bG3X9I7 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Zc3h12bG3X9I7 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Zc3h12bG3X9I7 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Zc3h12bG3X9I7 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Zc3h12bG3X9I7 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Zc3h12bG3X9I7 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Zc3h12bG3X9I7 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Zc3h12bG3X9I7 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Zc3h12bG3X9I7 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Zc3h12bG3X9I7 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Zc3h12bG3X9I7 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Zc3h12bG3X9I7 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Zc3h12bG3X9I7 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Zc3h12bG3X9I7 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Zc3h12bG3X9I7 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Zc3h12bG3X9I7 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Zc3h12bG3X9I7 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Zc3h12bG3X9I7 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Zc3h12bG3X9I7 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Zc3h12bG3X9I7 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Zc3h12bG3X9I7 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Zc3h12bG3X9I7 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Zc3h12bG3X9I7 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Zc3h12bG3X9I7 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Zc3h12bG3X9I7 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Zc3h12bG3X9I7 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Zc3h12bG3X9I7 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Zc3h12bG3X9I7 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Zc3h12bG3X9I7 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Zc3h12bG3X9I7 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Zc3h12bG3X9I7 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Zc3h12bG3X9I7 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Zc3h12bG3X9I7 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Zc3h12bG3X9I7 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Zc3h12bG3X9I7 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Zc3h12bG3X9I7 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Zc3h12bG3X9I7 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Zc3h12bG3X9I7 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Zc3h12bG3X9I7 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Zc3h12bG3X9I7 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Zc3h12bG3X9I7 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Zc3h12bG3X9I7 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Zc3h12bG3X9I7 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Zc3h12bG3X9I7 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Zc3h12bG3X9I7 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Zc3h12bG3X9I7 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Zc3h12bG3X9I7 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Zc3h12bG3X9I7 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Zc3h12bG3X9I7 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Zc3h12bG3X9I7 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Zc3h12bG3X9I7 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Zc3h12bG3X9I7 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Zc3h12bG3X9I7 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Zc3h12bG3X9I7 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Zc3h12bG3X9I7 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Zc3h12bG3X9I7 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Zc3h12bG3X9I7 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Zc3h12bG3X9I7 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Zc3h12bG3X9I7 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Zc3h12bG3X9I7 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Zc3h12bG3X9I7 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Zc3h12bG3X9I7 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Zc3h12bG3X9I7 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Zc3h12bG3X9I7 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Zc3h12bG3X9I7 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Zc3h12bG3X9I7 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Zc3h12bG3X9I7 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Zc3h12bG3X9I7 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Zc3h12bG3X9I7 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Zc3h12bG3X9I7 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Zc3h12bG3X9I7 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Zc3h12bG3X9I7 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Zc3h12bG3X9I7 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Zc3h12bG3X9I7 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Zc3h12bG3X9I7 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Zc3h12bG3X9I7 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Zc3h12bG3X9I7 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Zc3h12bG3X9I7 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Zc3h12bG3X9I7 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Zc3h12bG3X9I7 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Zc3h12bG3X9I7 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Zc3h12bG3X9I7 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Zc3h12bG3X9I7 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Zc3h12bG3X9I7 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Zc3h12bG3X9I7 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Zc3h12bG3X9I7 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Zc3h12bG3X9I7 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Zc3h12bG3X9I7 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Zc3h12bG3X9I7 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Zc3h12bG3X9I7 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Zc3h12bG3X9I7 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Zc3h12bG3X9I7 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Zc3h12bG3X9I7 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Zc3h12bG3X9I7 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Zc3h12bG3X9I7 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms