Protein–RNA interactions for Protein: G3X952

Zkscan2, MCG20985, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 960 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zkscan2G3X952 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Zkscan2G3X952 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Zkscan2G3X952 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Zkscan2G3X952 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Zkscan2G3X952 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Zkscan2G3X952 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Zkscan2G3X952 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Zkscan2G3X952 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Zkscan2G3X952 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Zkscan2G3X952 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Zkscan2G3X952 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Zkscan2G3X952 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Zkscan2G3X952 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Zkscan2G3X952 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Zkscan2G3X952 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Zkscan2G3X952 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Zkscan2G3X952 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Zkscan2G3X952 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Zkscan2G3X952 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Zkscan2G3X952 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Zkscan2G3X952 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Zkscan2G3X952 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Zkscan2G3X952 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Zkscan2G3X952 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Zkscan2G3X952 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Zkscan2G3X952 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Zkscan2G3X952 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Zkscan2G3X952 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Zkscan2G3X952 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Zkscan2G3X952 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Zkscan2G3X952 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Zkscan2G3X952 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Zkscan2G3X952 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Zkscan2G3X952 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Zkscan2G3X952 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Zkscan2G3X952 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Zkscan2G3X952 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Zkscan2G3X952 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Zkscan2G3X952 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Zkscan2G3X952 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Zkscan2G3X952 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Zkscan2G3X952 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Zkscan2G3X952 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Zkscan2G3X952 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Zkscan2G3X952 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Zkscan2G3X952 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Zkscan2G3X952 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Zkscan2G3X952 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Zkscan2G3X952 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Zkscan2G3X952 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Zkscan2G3X952 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Zkscan2G3X952 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Zkscan2G3X952 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Zkscan2G3X952 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Zkscan2G3X952 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Zkscan2G3X952 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Zkscan2G3X952 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Zkscan2G3X952 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Zkscan2G3X952 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Zkscan2G3X952 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Zkscan2G3X952 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Zkscan2G3X952 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Zkscan2G3X952 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Zkscan2G3X952 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Zkscan2G3X952 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Zkscan2G3X952 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Zkscan2G3X952 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Zkscan2G3X952 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Zkscan2G3X952 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Zkscan2G3X952 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Zkscan2G3X952 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Zkscan2G3X952 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Zkscan2G3X952 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Zkscan2G3X952 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Zkscan2G3X952 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Zkscan2G3X952 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Zkscan2G3X952 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Zkscan2G3X952 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Zkscan2G3X952 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Zkscan2G3X952 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Zkscan2G3X952 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Zkscan2G3X952 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Zkscan2G3X952 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Zkscan2G3X952 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Zkscan2G3X952 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Zkscan2G3X952 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Zkscan2G3X952 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Zkscan2G3X952 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Zkscan2G3X952 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Zkscan2G3X952 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Zkscan2G3X952 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Zkscan2G3X952 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Zkscan2G3X952 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Zkscan2G3X952 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Zkscan2G3X952 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Zkscan2G3X952 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Zkscan2G3X952 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Zkscan2G3X952 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Zkscan2G3X952 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Zkscan2G3X952 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.2 ms