Protein–RNA interactions for Protein: G3X912

Sprtn, SprT-like domain-containing protein Spartan, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SprtnG3X912 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SprtnG3X912 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SprtnG3X912 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SprtnG3X912 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SprtnG3X912 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SprtnG3X912 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SprtnG3X912 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SprtnG3X912 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SprtnG3X912 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SprtnG3X912 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SprtnG3X912 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SprtnG3X912 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SprtnG3X912 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SprtnG3X912 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SprtnG3X912 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SprtnG3X912 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SprtnG3X912 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SprtnG3X912 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SprtnG3X912 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
SprtnG3X912 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SprtnG3X912 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SprtnG3X912 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SprtnG3X912 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SprtnG3X912 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SprtnG3X912 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SprtnG3X912 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
SprtnG3X912 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SprtnG3X912 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SprtnG3X912 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SprtnG3X912 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SprtnG3X912 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SprtnG3X912 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SprtnG3X912 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SprtnG3X912 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SprtnG3X912 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SprtnG3X912 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SprtnG3X912 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SprtnG3X912 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SprtnG3X912 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
SprtnG3X912 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
SprtnG3X912 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SprtnG3X912 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SprtnG3X912 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SprtnG3X912 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SprtnG3X912 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SprtnG3X912 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SprtnG3X912 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SprtnG3X912 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SprtnG3X912 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SprtnG3X912 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
SprtnG3X912 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SprtnG3X912 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SprtnG3X912 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SprtnG3X912 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
SprtnG3X912 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SprtnG3X912 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SprtnG3X912 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SprtnG3X912 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SprtnG3X912 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SprtnG3X912 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SprtnG3X912 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SprtnG3X912 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SprtnG3X912 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SprtnG3X912 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SprtnG3X912 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SprtnG3X912 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SprtnG3X912 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SprtnG3X912 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SprtnG3X912 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SprtnG3X912 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SprtnG3X912 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SprtnG3X912 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SprtnG3X912 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SprtnG3X912 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SprtnG3X912 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SprtnG3X912 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SprtnG3X912 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SprtnG3X912 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SprtnG3X912 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SprtnG3X912 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SprtnG3X912 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SprtnG3X912 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
SprtnG3X912 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
SprtnG3X912 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
SprtnG3X912 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
SprtnG3X912 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SprtnG3X912 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SprtnG3X912 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SprtnG3X912 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SprtnG3X912 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SprtnG3X912 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SprtnG3X912 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SprtnG3X912 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SprtnG3X912 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SprtnG3X912 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
SprtnG3X912 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SprtnG3X912 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SprtnG3X912 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SprtnG3X912 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SprtnG3X912 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms