Protein–RNA interactions for Protein: G3UWE6

Vmn1r39, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r39G3UWE6 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Vmn1r39G3UWE6 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Vmn1r39G3UWE6 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Vmn1r39G3UWE6 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Vmn1r39G3UWE6 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Vmn1r39G3UWE6 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Vmn1r39G3UWE6 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Vmn1r39G3UWE6 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Vmn1r39G3UWE6 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Vmn1r39G3UWE6 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Vmn1r39G3UWE6 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Vmn1r39G3UWE6 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Vmn1r39G3UWE6 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Vmn1r39G3UWE6 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Vmn1r39G3UWE6 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Vmn1r39G3UWE6 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Vmn1r39G3UWE6 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Vmn1r39G3UWE6 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Vmn1r39G3UWE6 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Vmn1r39G3UWE6 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Vmn1r39G3UWE6 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Vmn1r39G3UWE6 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Vmn1r39G3UWE6 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Vmn1r39G3UWE6 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Vmn1r39G3UWE6 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Vmn1r39G3UWE6 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Vmn1r39G3UWE6 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Vmn1r39G3UWE6 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Vmn1r39G3UWE6 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Vmn1r39G3UWE6 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Vmn1r39G3UWE6 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Vmn1r39G3UWE6 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Vmn1r39G3UWE6 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Vmn1r39G3UWE6 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Vmn1r39G3UWE6 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Vmn1r39G3UWE6 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Vmn1r39G3UWE6 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Vmn1r39G3UWE6 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Vmn1r39G3UWE6 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Vmn1r39G3UWE6 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Vmn1r39G3UWE6 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Vmn1r39G3UWE6 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Vmn1r39G3UWE6 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Vmn1r39G3UWE6 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Vmn1r39G3UWE6 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Vmn1r39G3UWE6 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Vmn1r39G3UWE6 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Vmn1r39G3UWE6 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Vmn1r39G3UWE6 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Vmn1r39G3UWE6 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Vmn1r39G3UWE6 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Vmn1r39G3UWE6 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Vmn1r39G3UWE6 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Vmn1r39G3UWE6 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Vmn1r39G3UWE6 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Vmn1r39G3UWE6 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Vmn1r39G3UWE6 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Vmn1r39G3UWE6 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Vmn1r39G3UWE6 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Vmn1r39G3UWE6 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Vmn1r39G3UWE6 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Vmn1r39G3UWE6 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Vmn1r39G3UWE6 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Vmn1r39G3UWE6 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Vmn1r39G3UWE6 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Vmn1r39G3UWE6 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Vmn1r39G3UWE6 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Vmn1r39G3UWE6 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Vmn1r39G3UWE6 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Vmn1r39G3UWE6 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Vmn1r39G3UWE6 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Vmn1r39G3UWE6 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Vmn1r39G3UWE6 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Vmn1r39G3UWE6 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Vmn1r39G3UWE6 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Vmn1r39G3UWE6 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Vmn1r39G3UWE6 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Vmn1r39G3UWE6 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Vmn1r39G3UWE6 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Vmn1r39G3UWE6 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Vmn1r39G3UWE6 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Vmn1r39G3UWE6 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Vmn1r39G3UWE6 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Vmn1r39G3UWE6 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Vmn1r39G3UWE6 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Vmn1r39G3UWE6 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Vmn1r39G3UWE6 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Vmn1r39G3UWE6 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Vmn1r39G3UWE6 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Vmn1r39G3UWE6 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Vmn1r39G3UWE6 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Vmn1r39G3UWE6 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Vmn1r39G3UWE6 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Vmn1r39G3UWE6 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Vmn1r39G3UWE6 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Vmn1r39G3UWE6 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Vmn1r39G3UWE6 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Vmn1r39G3UWE6 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Vmn1r39G3UWE6 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Vmn1r39G3UWE6 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms