Protein–RNA interactions for Protein: G3UW87

Gm17455, MCG55969, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Gm17455G3UW87 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm17455G3UW87 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm17455G3UW87 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm17455G3UW87 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm17455G3UW87 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm17455G3UW87 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm17455G3UW87 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm17455G3UW87 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm17455G3UW87 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm17455G3UW87 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm17455G3UW87 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
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Gm17455G3UW87 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
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Gm17455G3UW87 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm17455G3UW87 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm17455G3UW87 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm17455G3UW87 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm17455G3UW87 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm17455G3UW87 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm17455G3UW87 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm17455G3UW87 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm17455G3UW87 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm17455G3UW87 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm17455G3UW87 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm17455G3UW87 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
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Gm17455G3UW87 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm17455G3UW87 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm17455G3UW87 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm17455G3UW87 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm17455G3UW87 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm17455G3UW87 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
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Gm17455G3UW87 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm17455G3UW87 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm17455G3UW87 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
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Gm17455G3UW87 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
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Gm17455G3UW87 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm17455G3UW87 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm17455G3UW87 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm17455G3UW87 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
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Gm17455G3UW87 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm17455G3UW87 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm17455G3UW87 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
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Gm17455G3UW87 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gm17455G3UW87 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
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Gm17455G3UW87 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm17455G3UW87 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm17455G3UW87 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm17455G3UW87 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm17455G3UW87 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm17455G3UW87 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm17455G3UW87 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm17455G3UW87 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm17455G3UW87 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm17455G3UW87 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm17455G3UW87 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm17455G3UW87 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm17455G3UW87 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm17455G3UW87 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm17455G3UW87 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm17455G3UW87 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm17455G3UW87 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm17455G3UW87 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm17455G3UW87 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm17455G3UW87 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm17455G3UW87 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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