Protein–RNA interactions for Protein: G3UW52

Cldn34a, Claudin 34A, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34aG3UW52 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cldn34aG3UW52 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cldn34aG3UW52 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cldn34aG3UW52 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cldn34aG3UW52 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cldn34aG3UW52 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cldn34aG3UW52 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cldn34aG3UW52 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cldn34aG3UW52 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cldn34aG3UW52 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cldn34aG3UW52 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cldn34aG3UW52 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cldn34aG3UW52 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Cldn34aG3UW52 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cldn34aG3UW52 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cldn34aG3UW52 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cldn34aG3UW52 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cldn34aG3UW52 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cldn34aG3UW52 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cldn34aG3UW52 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cldn34aG3UW52 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cldn34aG3UW52 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cldn34aG3UW52 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cldn34aG3UW52 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cldn34aG3UW52 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cldn34aG3UW52 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cldn34aG3UW52 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cldn34aG3UW52 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cldn34aG3UW52 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cldn34aG3UW52 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cldn34aG3UW52 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cldn34aG3UW52 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cldn34aG3UW52 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cldn34aG3UW52 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Cldn34aG3UW52 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cldn34aG3UW52 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cldn34aG3UW52 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cldn34aG3UW52 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cldn34aG3UW52 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cldn34aG3UW52 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Cldn34aG3UW52 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cldn34aG3UW52 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cldn34aG3UW52 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cldn34aG3UW52 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cldn34aG3UW52 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cldn34aG3UW52 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cldn34aG3UW52 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cldn34aG3UW52 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cldn34aG3UW52 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cldn34aG3UW52 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cldn34aG3UW52 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cldn34aG3UW52 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cldn34aG3UW52 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cldn34aG3UW52 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cldn34aG3UW52 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cldn34aG3UW52 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cldn34aG3UW52 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cldn34aG3UW52 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cldn34aG3UW52 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cldn34aG3UW52 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cldn34aG3UW52 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cldn34aG3UW52 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cldn34aG3UW52 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cldn34aG3UW52 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cldn34aG3UW52 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cldn34aG3UW52 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cldn34aG3UW52 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cldn34aG3UW52 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cldn34aG3UW52 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cldn34aG3UW52 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cldn34aG3UW52 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cldn34aG3UW52 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cldn34aG3UW52 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cldn34aG3UW52 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cldn34aG3UW52 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cldn34aG3UW52 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cldn34aG3UW52 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cldn34aG3UW52 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cldn34aG3UW52 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cldn34aG3UW52 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cldn34aG3UW52 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cldn34aG3UW52 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Cldn34aG3UW52 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cldn34aG3UW52 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cldn34aG3UW52 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cldn34aG3UW52 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cldn34aG3UW52 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cldn34aG3UW52 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cldn34aG3UW52 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cldn34aG3UW52 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cldn34aG3UW52 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cldn34aG3UW52 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cldn34aG3UW52 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Cldn34aG3UW52 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cldn34aG3UW52 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cldn34aG3UW52 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cldn34aG3UW52 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cldn34aG3UW52 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cldn34aG3UW52 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cldn34aG3UW52 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms