Protein–RNA interactions for Protein: F8VQC1

Srp72, Signal recognition particle subunit SRP72, mousemouse

Predictions only

Length 671 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srp72F8VQC1 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Srp72F8VQC1 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Srp72F8VQC1 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Srp72F8VQC1 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Srp72F8VQC1 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Srp72F8VQC1 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Srp72F8VQC1 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Srp72F8VQC1 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Srp72F8VQC1 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Srp72F8VQC1 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Srp72F8VQC1 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Srp72F8VQC1 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Srp72F8VQC1 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Srp72F8VQC1 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Srp72F8VQC1 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Srp72F8VQC1 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Srp72F8VQC1 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Srp72F8VQC1 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Srp72F8VQC1 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Srp72F8VQC1 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Srp72F8VQC1 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Srp72F8VQC1 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Srp72F8VQC1 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Srp72F8VQC1 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Srp72F8VQC1 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Srp72F8VQC1 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Srp72F8VQC1 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Srp72F8VQC1 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Srp72F8VQC1 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Srp72F8VQC1 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Srp72F8VQC1 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Srp72F8VQC1 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Srp72F8VQC1 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Srp72F8VQC1 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Srp72F8VQC1 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Srp72F8VQC1 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Srp72F8VQC1 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Srp72F8VQC1 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Srp72F8VQC1 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Srp72F8VQC1 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Srp72F8VQC1 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Srp72F8VQC1 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Srp72F8VQC1 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Srp72F8VQC1 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Srp72F8VQC1 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Srp72F8VQC1 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Srp72F8VQC1 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Srp72F8VQC1 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Srp72F8VQC1 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Srp72F8VQC1 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Srp72F8VQC1 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Srp72F8VQC1 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Srp72F8VQC1 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Srp72F8VQC1 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Srp72F8VQC1 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Srp72F8VQC1 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Srp72F8VQC1 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Srp72F8VQC1 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Srp72F8VQC1 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Srp72F8VQC1 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Srp72F8VQC1 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Srp72F8VQC1 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Srp72F8VQC1 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Srp72F8VQC1 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Srp72F8VQC1 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Srp72F8VQC1 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Srp72F8VQC1 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Srp72F8VQC1 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Srp72F8VQC1 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Srp72F8VQC1 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Srp72F8VQC1 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Srp72F8VQC1 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Srp72F8VQC1 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Srp72F8VQC1 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Srp72F8VQC1 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Srp72F8VQC1 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Srp72F8VQC1 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Srp72F8VQC1 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Srp72F8VQC1 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Srp72F8VQC1 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Srp72F8VQC1 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Srp72F8VQC1 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Srp72F8VQC1 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Srp72F8VQC1 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Srp72F8VQC1 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Srp72F8VQC1 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Srp72F8VQC1 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Srp72F8VQC1 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Srp72F8VQC1 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Srp72F8VQC1 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Srp72F8VQC1 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Srp72F8VQC1 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Srp72F8VQC1 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Srp72F8VQC1 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Srp72F8VQC1 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Srp72F8VQC1 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Srp72F8VQC1 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Srp72F8VQC1 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Srp72F8VQC1 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Srp72F8VQC1 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms