Protein–RNA interactions for Protein: F8VQB8

Npcd, Neuronal pentraxin chromo domain, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NpcdF8VQB8 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NpcdF8VQB8 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NpcdF8VQB8 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NpcdF8VQB8 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NpcdF8VQB8 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NpcdF8VQB8 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NpcdF8VQB8 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NpcdF8VQB8 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NpcdF8VQB8 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NpcdF8VQB8 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NpcdF8VQB8 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NpcdF8VQB8 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NpcdF8VQB8 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NpcdF8VQB8 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NpcdF8VQB8 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NpcdF8VQB8 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NpcdF8VQB8 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NpcdF8VQB8 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NpcdF8VQB8 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NpcdF8VQB8 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NpcdF8VQB8 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NpcdF8VQB8 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NpcdF8VQB8 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NpcdF8VQB8 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NpcdF8VQB8 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NpcdF8VQB8 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NpcdF8VQB8 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NpcdF8VQB8 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NpcdF8VQB8 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NpcdF8VQB8 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
NpcdF8VQB8 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
NpcdF8VQB8 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NpcdF8VQB8 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NpcdF8VQB8 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NpcdF8VQB8 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
NpcdF8VQB8 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NpcdF8VQB8 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NpcdF8VQB8 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NpcdF8VQB8 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NpcdF8VQB8 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
NpcdF8VQB8 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NpcdF8VQB8 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NpcdF8VQB8 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NpcdF8VQB8 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NpcdF8VQB8 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
NpcdF8VQB8 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
NpcdF8VQB8 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
NpcdF8VQB8 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NpcdF8VQB8 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NpcdF8VQB8 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
NpcdF8VQB8 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NpcdF8VQB8 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NpcdF8VQB8 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NpcdF8VQB8 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NpcdF8VQB8 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NpcdF8VQB8 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NpcdF8VQB8 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NpcdF8VQB8 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NpcdF8VQB8 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NpcdF8VQB8 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NpcdF8VQB8 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NpcdF8VQB8 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
NpcdF8VQB8 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
NpcdF8VQB8 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NpcdF8VQB8 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
NpcdF8VQB8 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NpcdF8VQB8 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NpcdF8VQB8 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NpcdF8VQB8 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NpcdF8VQB8 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NpcdF8VQB8 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NpcdF8VQB8 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NpcdF8VQB8 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
NpcdF8VQB8 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NpcdF8VQB8 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NpcdF8VQB8 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NpcdF8VQB8 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NpcdF8VQB8 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NpcdF8VQB8 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NpcdF8VQB8 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NpcdF8VQB8 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NpcdF8VQB8 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NpcdF8VQB8 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NpcdF8VQB8 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
NpcdF8VQB8 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NpcdF8VQB8 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NpcdF8VQB8 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NpcdF8VQB8 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NpcdF8VQB8 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NpcdF8VQB8 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NpcdF8VQB8 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NpcdF8VQB8 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NpcdF8VQB8 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NpcdF8VQB8 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NpcdF8VQB8 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NpcdF8VQB8 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NpcdF8VQB8 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NpcdF8VQB8 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NpcdF8VQB8 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NpcdF8VQB8 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 143.1 ms