Protein–RNA interactions for Protein: F8VPU6

Usp9y, Ubiquitin-specific peptidase 9, Y chromosome, mousemouse

Predictions only

Length 2,556 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp9yF8VPU6 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp9yF8VPU6 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp9yF8VPU6 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp9yF8VPU6 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp9yF8VPU6 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp9yF8VPU6 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp9yF8VPU6 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp9yF8VPU6 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp9yF8VPU6 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp9yF8VPU6 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp9yF8VPU6 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp9yF8VPU6 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp9yF8VPU6 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp9yF8VPU6 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp9yF8VPU6 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp9yF8VPU6 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp9yF8VPU6 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp9yF8VPU6 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp9yF8VPU6 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp9yF8VPU6 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp9yF8VPU6 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp9yF8VPU6 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp9yF8VPU6 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp9yF8VPU6 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp9yF8VPU6 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp9yF8VPU6 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp9yF8VPU6 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp9yF8VPU6 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp9yF8VPU6 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp9yF8VPU6 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp9yF8VPU6 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp9yF8VPU6 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp9yF8VPU6 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp9yF8VPU6 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp9yF8VPU6 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp9yF8VPU6 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp9yF8VPU6 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp9yF8VPU6 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp9yF8VPU6 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp9yF8VPU6 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp9yF8VPU6 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp9yF8VPU6 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp9yF8VPU6 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp9yF8VPU6 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp9yF8VPU6 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp9yF8VPU6 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp9yF8VPU6 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp9yF8VPU6 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp9yF8VPU6 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp9yF8VPU6 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp9yF8VPU6 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp9yF8VPU6 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp9yF8VPU6 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp9yF8VPU6 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp9yF8VPU6 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp9yF8VPU6 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp9yF8VPU6 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp9yF8VPU6 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp9yF8VPU6 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp9yF8VPU6 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp9yF8VPU6 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp9yF8VPU6 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp9yF8VPU6 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp9yF8VPU6 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp9yF8VPU6 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp9yF8VPU6 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp9yF8VPU6 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp9yF8VPU6 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp9yF8VPU6 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp9yF8VPU6 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp9yF8VPU6 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp9yF8VPU6 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp9yF8VPU6 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp9yF8VPU6 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp9yF8VPU6 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp9yF8VPU6 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp9yF8VPU6 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp9yF8VPU6 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp9yF8VPU6 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp9yF8VPU6 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp9yF8VPU6 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp9yF8VPU6 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp9yF8VPU6 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp9yF8VPU6 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp9yF8VPU6 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp9yF8VPU6 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp9yF8VPU6 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp9yF8VPU6 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp9yF8VPU6 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Usp9yF8VPU6 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Usp9yF8VPU6 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Usp9yF8VPU6 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Usp9yF8VPU6 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Usp9yF8VPU6 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Usp9yF8VPU6 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Usp9yF8VPU6 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Usp9yF8VPU6 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Usp9yF8VPU6 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Usp9yF8VPU6 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Usp9yF8VPU6 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57 ms