Protein–RNA interactions for Protein: F6Z9R1

Gm20538, Predicted gene 20538 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 75 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20538F6Z9R1 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Gm20538F6Z9R1 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm20538F6Z9R1 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm20538F6Z9R1 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm20538F6Z9R1 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm20538F6Z9R1 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm20538F6Z9R1 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm20538F6Z9R1 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm20538F6Z9R1 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm20538F6Z9R1 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm20538F6Z9R1 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm20538F6Z9R1 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm20538F6Z9R1 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm20538F6Z9R1 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm20538F6Z9R1 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm20538F6Z9R1 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm20538F6Z9R1 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm20538F6Z9R1 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm20538F6Z9R1 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm20538F6Z9R1 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm20538F6Z9R1 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Gm20538F6Z9R1 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Gm20538F6Z9R1 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Gm20538F6Z9R1 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Gm20538F6Z9R1 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Gm20538F6Z9R1 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Gm20538F6Z9R1 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Gm20538F6Z9R1 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Gm20538F6Z9R1 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Gm20538F6Z9R1 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Gm20538F6Z9R1 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Gm20538F6Z9R1 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Gm20538F6Z9R1 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
Gm20538F6Z9R1 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Gm20538F6Z9R1 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Gm20538F6Z9R1 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Gm20538F6Z9R1 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Gm20538F6Z9R1 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Gm20538F6Z9R1 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Gm20538F6Z9R1 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Gm20538F6Z9R1 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Gm20538F6Z9R1 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Gm20538F6Z9R1 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
Gm20538F6Z9R1 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Gm20538F6Z9R1 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Gm20538F6Z9R1 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Gm20538F6Z9R1 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Gm20538F6Z9R1 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Gm20538F6Z9R1 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Gm20538F6Z9R1 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Gm20538F6Z9R1 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Gm20538F6Z9R1 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Gm20538F6Z9R1 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Gm20538F6Z9R1 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Gm20538F6Z9R1 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Gm20538F6Z9R1 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Gm20538F6Z9R1 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Gm20538F6Z9R1 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Gm20538F6Z9R1 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Gm20538F6Z9R1 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Gm20538F6Z9R1 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Gm20538F6Z9R1 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Gm20538F6Z9R1 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Gm20538F6Z9R1 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Gm20538F6Z9R1 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Gm20538F6Z9R1 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Gm20538F6Z9R1 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Gm20538F6Z9R1 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Gm20538F6Z9R1 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Gm20538F6Z9R1 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Gm20538F6Z9R1 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Gm20538F6Z9R1 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Gm20538F6Z9R1 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Gm20538F6Z9R1 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Gm20538F6Z9R1 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Gm20538F6Z9R1 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Gm20538F6Z9R1 Dennd4c-202ENSMUST00000082026 7940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Gm20538F6Z9R1 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Gm20538F6Z9R1 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Gm20538F6Z9R1 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Gm20538F6Z9R1 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Gm20538F6Z9R1 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Gm20538F6Z9R1 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Gm20538F6Z9R1 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.88
Gm20538F6Z9R1 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.88
Gm20538F6Z9R1 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.88
Gm20538F6Z9R1 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Gm20538F6Z9R1 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Gm20538F6Z9R1 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Gm20538F6Z9R1 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Gm20538F6Z9R1 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Gm20538F6Z9R1 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Gm20538F6Z9R1 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Gm20538F6Z9R1 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Gm20538F6Z9R1 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Gm20538F6Z9R1 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Gm20538F6Z9R1 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Gm20538F6Z9R1 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Gm20538F6Z9R1 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Gm20538F6Z9R1 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms