Protein–RNA interactions for Protein: F6XWB2

Igkv1-99, Immunoglobulin kappa variable 1-99 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 120 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Igkv1-99F6XWB2 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Igkv1-99F6XWB2 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Igkv1-99F6XWB2 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Igkv1-99F6XWB2 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Igkv1-99F6XWB2 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Igkv1-99F6XWB2 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Igkv1-99F6XWB2 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Igkv1-99F6XWB2 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Igkv1-99F6XWB2 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Igkv1-99F6XWB2 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Igkv1-99F6XWB2 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Igkv1-99F6XWB2 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Igkv1-99F6XWB2 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Igkv1-99F6XWB2 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Igkv1-99F6XWB2 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Igkv1-99F6XWB2 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Igkv1-99F6XWB2 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Igkv1-99F6XWB2 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Igkv1-99F6XWB2 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Igkv1-99F6XWB2 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Igkv1-99F6XWB2 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Igkv1-99F6XWB2 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Igkv1-99F6XWB2 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Igkv1-99F6XWB2 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Igkv1-99F6XWB2 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Igkv1-99F6XWB2 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Igkv1-99F6XWB2 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Igkv1-99F6XWB2 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Igkv1-99F6XWB2 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Igkv1-99F6XWB2 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Igkv1-99F6XWB2 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Igkv1-99F6XWB2 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Igkv1-99F6XWB2 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Igkv1-99F6XWB2 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Igkv1-99F6XWB2 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Igkv1-99F6XWB2 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Igkv1-99F6XWB2 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Igkv1-99F6XWB2 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Igkv1-99F6XWB2 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Igkv1-99F6XWB2 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Igkv1-99F6XWB2 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Igkv1-99F6XWB2 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Igkv1-99F6XWB2 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Igkv1-99F6XWB2 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Igkv1-99F6XWB2 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Igkv1-99F6XWB2 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Igkv1-99F6XWB2 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Igkv1-99F6XWB2 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Igkv1-99F6XWB2 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Igkv1-99F6XWB2 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Igkv1-99F6XWB2 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Igkv1-99F6XWB2 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Igkv1-99F6XWB2 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Igkv1-99F6XWB2 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Igkv1-99F6XWB2 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Igkv1-99F6XWB2 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Igkv1-99F6XWB2 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Igkv1-99F6XWB2 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Igkv1-99F6XWB2 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Igkv1-99F6XWB2 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Igkv1-99F6XWB2 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Igkv1-99F6XWB2 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Igkv1-99F6XWB2 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Igkv1-99F6XWB2 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Igkv1-99F6XWB2 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Igkv1-99F6XWB2 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Igkv1-99F6XWB2 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Igkv1-99F6XWB2 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Igkv1-99F6XWB2 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Igkv1-99F6XWB2 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Igkv1-99F6XWB2 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Igkv1-99F6XWB2 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Igkv1-99F6XWB2 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Igkv1-99F6XWB2 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Igkv1-99F6XWB2 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Igkv1-99F6XWB2 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Igkv1-99F6XWB2 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Igkv1-99F6XWB2 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Igkv1-99F6XWB2 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Igkv1-99F6XWB2 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Igkv1-99F6XWB2 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Igkv1-99F6XWB2 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Igkv1-99F6XWB2 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Igkv1-99F6XWB2 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Igkv1-99F6XWB2 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Igkv1-99F6XWB2 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Igkv1-99F6XWB2 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Igkv1-99F6XWB2 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Igkv1-99F6XWB2 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Igkv1-99F6XWB2 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Igkv1-99F6XWB2 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Igkv1-99F6XWB2 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Igkv1-99F6XWB2 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Igkv1-99F6XWB2 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Igkv1-99F6XWB2 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Igkv1-99F6XWB2 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Igkv1-99F6XWB2 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Igkv1-99F6XWB2 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Igkv1-99F6XWB2 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Igkv1-99F6XWB2 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms