Protein–RNA interactions for Protein: F6V0H0

Pagr1b, PAXIP1-associated glutamate-rich protein 1B (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pagr1bF6V0H0 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Pagr1bF6V0H0 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Pagr1bF6V0H0 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Pagr1bF6V0H0 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Pagr1bF6V0H0 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Pagr1bF6V0H0 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pagr1bF6V0H0 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pagr1bF6V0H0 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pagr1bF6V0H0 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pagr1bF6V0H0 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pagr1bF6V0H0 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pagr1bF6V0H0 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pagr1bF6V0H0 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pagr1bF6V0H0 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pagr1bF6V0H0 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pagr1bF6V0H0 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pagr1bF6V0H0 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pagr1bF6V0H0 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pagr1bF6V0H0 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pagr1bF6V0H0 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pagr1bF6V0H0 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pagr1bF6V0H0 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pagr1bF6V0H0 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pagr1bF6V0H0 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pagr1bF6V0H0 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pagr1bF6V0H0 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pagr1bF6V0H0 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pagr1bF6V0H0 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pagr1bF6V0H0 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pagr1bF6V0H0 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pagr1bF6V0H0 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Pagr1bF6V0H0 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pagr1bF6V0H0 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pagr1bF6V0H0 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pagr1bF6V0H0 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pagr1bF6V0H0 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pagr1bF6V0H0 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pagr1bF6V0H0 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pagr1bF6V0H0 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pagr1bF6V0H0 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pagr1bF6V0H0 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pagr1bF6V0H0 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pagr1bF6V0H0 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pagr1bF6V0H0 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pagr1bF6V0H0 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pagr1bF6V0H0 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pagr1bF6V0H0 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pagr1bF6V0H0 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pagr1bF6V0H0 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pagr1bF6V0H0 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pagr1bF6V0H0 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pagr1bF6V0H0 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pagr1bF6V0H0 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pagr1bF6V0H0 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pagr1bF6V0H0 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Pagr1bF6V0H0 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Pagr1bF6V0H0 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Pagr1bF6V0H0 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Pagr1bF6V0H0 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Pagr1bF6V0H0 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Pagr1bF6V0H0 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Pagr1bF6V0H0 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Pagr1bF6V0H0 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Pagr1bF6V0H0 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Pagr1bF6V0H0 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Pagr1bF6V0H0 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Pagr1bF6V0H0 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Pagr1bF6V0H0 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Pagr1bF6V0H0 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Pagr1bF6V0H0 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pagr1bF6V0H0 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pagr1bF6V0H0 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pagr1bF6V0H0 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pagr1bF6V0H0 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pagr1bF6V0H0 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pagr1bF6V0H0 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Pagr1bF6V0H0 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pagr1bF6V0H0 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pagr1bF6V0H0 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pagr1bF6V0H0 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pagr1bF6V0H0 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pagr1bF6V0H0 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pagr1bF6V0H0 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pagr1bF6V0H0 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pagr1bF6V0H0 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pagr1bF6V0H0 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pagr1bF6V0H0 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pagr1bF6V0H0 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pagr1bF6V0H0 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pagr1bF6V0H0 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pagr1bF6V0H0 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pagr1bF6V0H0 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pagr1bF6V0H0 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pagr1bF6V0H0 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pagr1bF6V0H0 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pagr1bF6V0H0 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pagr1bF6V0H0 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Pagr1bF6V0H0 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pagr1bF6V0H0 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pagr1bF6V0H0 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms