Protein–RNA interactions for Protein: F6UCX4

Sptbn5, Spectrin beta, non-erythrocytic 5 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 1,208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sptbn5F6UCX4 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Sptbn5F6UCX4 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Sptbn5F6UCX4 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Sptbn5F6UCX4 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Sptbn5F6UCX4 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Sptbn5F6UCX4 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Sptbn5F6UCX4 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Sptbn5F6UCX4 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Sptbn5F6UCX4 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Sptbn5F6UCX4 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Sptbn5F6UCX4 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Sptbn5F6UCX4 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Sptbn5F6UCX4 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Sptbn5F6UCX4 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Sptbn5F6UCX4 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Sptbn5F6UCX4 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Sptbn5F6UCX4 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Sptbn5F6UCX4 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Sptbn5F6UCX4 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Sptbn5F6UCX4 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Sptbn5F6UCX4 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Sptbn5F6UCX4 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Sptbn5F6UCX4 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Sptbn5F6UCX4 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Sptbn5F6UCX4 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Sptbn5F6UCX4 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Sptbn5F6UCX4 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Sptbn5F6UCX4 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Sptbn5F6UCX4 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Sptbn5F6UCX4 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Sptbn5F6UCX4 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Sptbn5F6UCX4 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Sptbn5F6UCX4 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Sptbn5F6UCX4 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Sptbn5F6UCX4 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Sptbn5F6UCX4 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Sptbn5F6UCX4 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Sptbn5F6UCX4 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Sptbn5F6UCX4 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Sptbn5F6UCX4 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Sptbn5F6UCX4 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Sptbn5F6UCX4 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Sptbn5F6UCX4 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Sptbn5F6UCX4 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Sptbn5F6UCX4 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Sptbn5F6UCX4 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Sptbn5F6UCX4 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Sptbn5F6UCX4 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Sptbn5F6UCX4 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Sptbn5F6UCX4 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Sptbn5F6UCX4 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Sptbn5F6UCX4 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Sptbn5F6UCX4 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Sptbn5F6UCX4 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Sptbn5F6UCX4 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Sptbn5F6UCX4 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Sptbn5F6UCX4 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Sptbn5F6UCX4 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Sptbn5F6UCX4 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Sptbn5F6UCX4 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Sptbn5F6UCX4 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Sptbn5F6UCX4 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Sptbn5F6UCX4 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Sptbn5F6UCX4 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Sptbn5F6UCX4 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Sptbn5F6UCX4 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Sptbn5F6UCX4 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Sptbn5F6UCX4 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Sptbn5F6UCX4 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Sptbn5F6UCX4 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Sptbn5F6UCX4 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Sptbn5F6UCX4 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Sptbn5F6UCX4 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Sptbn5F6UCX4 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Sptbn5F6UCX4 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Sptbn5F6UCX4 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Sptbn5F6UCX4 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Sptbn5F6UCX4 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Sptbn5F6UCX4 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Sptbn5F6UCX4 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Sptbn5F6UCX4 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Sptbn5F6UCX4 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Sptbn5F6UCX4 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Sptbn5F6UCX4 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Sptbn5F6UCX4 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Sptbn5F6UCX4 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Sptbn5F6UCX4 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Sptbn5F6UCX4 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Sptbn5F6UCX4 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Sptbn5F6UCX4 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Sptbn5F6UCX4 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Sptbn5F6UCX4 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Sptbn5F6UCX4 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Sptbn5F6UCX4 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Sptbn5F6UCX4 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Sptbn5F6UCX4 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Sptbn5F6UCX4 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Sptbn5F6UCX4 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Sptbn5F6UCX4 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Sptbn5F6UCX4 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms