Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9Y3

Ccdc7b, Coiled-coil domain-containing 7B, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc7bE9Q9Y3 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc7bE9Q9Y3 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc7bE9Q9Y3 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc7bE9Q9Y3 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc7bE9Q9Y3 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc7bE9Q9Y3 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc7bE9Q9Y3 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc7bE9Q9Y3 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc7bE9Q9Y3 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc7bE9Q9Y3 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc7bE9Q9Y3 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc7bE9Q9Y3 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc7bE9Q9Y3 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc7bE9Q9Y3 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc7bE9Q9Y3 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc7bE9Q9Y3 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc7bE9Q9Y3 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc7bE9Q9Y3 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc7bE9Q9Y3 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc7bE9Q9Y3 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc7bE9Q9Y3 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc7bE9Q9Y3 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc7bE9Q9Y3 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc7bE9Q9Y3 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc7bE9Q9Y3 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc7bE9Q9Y3 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc7bE9Q9Y3 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc7bE9Q9Y3 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc7bE9Q9Y3 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc7bE9Q9Y3 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc7bE9Q9Y3 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc7bE9Q9Y3 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc7bE9Q9Y3 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc7bE9Q9Y3 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc7bE9Q9Y3 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc7bE9Q9Y3 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc7bE9Q9Y3 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc7bE9Q9Y3 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc7bE9Q9Y3 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc7bE9Q9Y3 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc7bE9Q9Y3 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc7bE9Q9Y3 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc7bE9Q9Y3 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc7bE9Q9Y3 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc7bE9Q9Y3 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc7bE9Q9Y3 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc7bE9Q9Y3 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc7bE9Q9Y3 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc7bE9Q9Y3 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc7bE9Q9Y3 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc7bE9Q9Y3 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc7bE9Q9Y3 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc7bE9Q9Y3 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc7bE9Q9Y3 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc7bE9Q9Y3 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc7bE9Q9Y3 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc7bE9Q9Y3 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc7bE9Q9Y3 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc7bE9Q9Y3 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc7bE9Q9Y3 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc7bE9Q9Y3 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc7bE9Q9Y3 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc7bE9Q9Y3 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc7bE9Q9Y3 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc7bE9Q9Y3 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc7bE9Q9Y3 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc7bE9Q9Y3 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc7bE9Q9Y3 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc7bE9Q9Y3 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ccdc7bE9Q9Y3 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc7bE9Q9Y3 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc7bE9Q9Y3 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc7bE9Q9Y3 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc7bE9Q9Y3 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc7bE9Q9Y3 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc7bE9Q9Y3 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc7bE9Q9Y3 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc7bE9Q9Y3 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc7bE9Q9Y3 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc7bE9Q9Y3 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc7bE9Q9Y3 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc7bE9Q9Y3 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc7bE9Q9Y3 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc7bE9Q9Y3 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc7bE9Q9Y3 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc7bE9Q9Y3 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc7bE9Q9Y3 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc7bE9Q9Y3 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc7bE9Q9Y3 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc7bE9Q9Y3 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc7bE9Q9Y3 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc7bE9Q9Y3 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc7bE9Q9Y3 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc7bE9Q9Y3 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc7bE9Q9Y3 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc7bE9Q9Y3 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc7bE9Q9Y3 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms