Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9W7

Pdzd7, PDZ domain-containing 7, mousemouse

Predictions only

Length 1,021 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd7E9Q9W7 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pdzd7E9Q9W7 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pdzd7E9Q9W7 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pdzd7E9Q9W7 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pdzd7E9Q9W7 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pdzd7E9Q9W7 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pdzd7E9Q9W7 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pdzd7E9Q9W7 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pdzd7E9Q9W7 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pdzd7E9Q9W7 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pdzd7E9Q9W7 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pdzd7E9Q9W7 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pdzd7E9Q9W7 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pdzd7E9Q9W7 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pdzd7E9Q9W7 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pdzd7E9Q9W7 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pdzd7E9Q9W7 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Pdzd7E9Q9W7 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pdzd7E9Q9W7 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pdzd7E9Q9W7 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pdzd7E9Q9W7 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pdzd7E9Q9W7 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pdzd7E9Q9W7 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pdzd7E9Q9W7 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pdzd7E9Q9W7 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pdzd7E9Q9W7 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pdzd7E9Q9W7 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pdzd7E9Q9W7 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Pdzd7E9Q9W7 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pdzd7E9Q9W7 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pdzd7E9Q9W7 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pdzd7E9Q9W7 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pdzd7E9Q9W7 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pdzd7E9Q9W7 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pdzd7E9Q9W7 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pdzd7E9Q9W7 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pdzd7E9Q9W7 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pdzd7E9Q9W7 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pdzd7E9Q9W7 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pdzd7E9Q9W7 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pdzd7E9Q9W7 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pdzd7E9Q9W7 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pdzd7E9Q9W7 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pdzd7E9Q9W7 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pdzd7E9Q9W7 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pdzd7E9Q9W7 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pdzd7E9Q9W7 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Pdzd7E9Q9W7 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Pdzd7E9Q9W7 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Pdzd7E9Q9W7 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Pdzd7E9Q9W7 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Pdzd7E9Q9W7 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Pdzd7E9Q9W7 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Pdzd7E9Q9W7 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Pdzd7E9Q9W7 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pdzd7E9Q9W7 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pdzd7E9Q9W7 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pdzd7E9Q9W7 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pdzd7E9Q9W7 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pdzd7E9Q9W7 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pdzd7E9Q9W7 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pdzd7E9Q9W7 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pdzd7E9Q9W7 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pdzd7E9Q9W7 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pdzd7E9Q9W7 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pdzd7E9Q9W7 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pdzd7E9Q9W7 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pdzd7E9Q9W7 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pdzd7E9Q9W7 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pdzd7E9Q9W7 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pdzd7E9Q9W7 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pdzd7E9Q9W7 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Pdzd7E9Q9W7 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pdzd7E9Q9W7 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pdzd7E9Q9W7 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pdzd7E9Q9W7 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pdzd7E9Q9W7 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pdzd7E9Q9W7 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pdzd7E9Q9W7 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pdzd7E9Q9W7 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pdzd7E9Q9W7 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pdzd7E9Q9W7 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pdzd7E9Q9W7 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pdzd7E9Q9W7 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pdzd7E9Q9W7 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pdzd7E9Q9W7 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pdzd7E9Q9W7 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pdzd7E9Q9W7 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pdzd7E9Q9W7 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pdzd7E9Q9W7 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pdzd7E9Q9W7 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pdzd7E9Q9W7 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pdzd7E9Q9W7 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Pdzd7E9Q9W7 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pdzd7E9Q9W7 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pdzd7E9Q9W7 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pdzd7E9Q9W7 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pdzd7E9Q9W7 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pdzd7E9Q9W7 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pdzd7E9Q9W7 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.9 ms