Protein–RNA interactions for Protein: E9Q8N6

Aknad1, AKNA domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 675 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aknad1E9Q8N6 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Aknad1E9Q8N6 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Aknad1E9Q8N6 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Aknad1E9Q8N6 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
Aknad1E9Q8N6 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Aknad1E9Q8N6 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Aknad1E9Q8N6 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Aknad1E9Q8N6 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Aknad1E9Q8N6 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Aknad1E9Q8N6 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Aknad1E9Q8N6 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Aknad1E9Q8N6 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Aknad1E9Q8N6 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Aknad1E9Q8N6 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Aknad1E9Q8N6 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Aknad1E9Q8N6 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Aknad1E9Q8N6 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Aknad1E9Q8N6 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Aknad1E9Q8N6 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Aknad1E9Q8N6 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Aknad1E9Q8N6 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Aknad1E9Q8N6 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Aknad1E9Q8N6 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Aknad1E9Q8N6 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Aknad1E9Q8N6 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Aknad1E9Q8N6 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Aknad1E9Q8N6 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Aknad1E9Q8N6 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Aknad1E9Q8N6 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Aknad1E9Q8N6 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Aknad1E9Q8N6 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Aknad1E9Q8N6 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Aknad1E9Q8N6 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Aknad1E9Q8N6 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Aknad1E9Q8N6 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Aknad1E9Q8N6 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Aknad1E9Q8N6 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Aknad1E9Q8N6 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Aknad1E9Q8N6 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Aknad1E9Q8N6 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Aknad1E9Q8N6 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Aknad1E9Q8N6 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Aknad1E9Q8N6 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Aknad1E9Q8N6 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Aknad1E9Q8N6 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Aknad1E9Q8N6 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Aknad1E9Q8N6 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Aknad1E9Q8N6 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Aknad1E9Q8N6 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Aknad1E9Q8N6 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Aknad1E9Q8N6 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Aknad1E9Q8N6 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Aknad1E9Q8N6 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Aknad1E9Q8N6 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Aknad1E9Q8N6 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Aknad1E9Q8N6 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Aknad1E9Q8N6 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Aknad1E9Q8N6 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Aknad1E9Q8N6 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Aknad1E9Q8N6 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Aknad1E9Q8N6 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Aknad1E9Q8N6 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Aknad1E9Q8N6 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Aknad1E9Q8N6 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Aknad1E9Q8N6 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Aknad1E9Q8N6 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Aknad1E9Q8N6 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Aknad1E9Q8N6 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Aknad1E9Q8N6 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Aknad1E9Q8N6 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Aknad1E9Q8N6 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Aknad1E9Q8N6 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Aknad1E9Q8N6 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Aknad1E9Q8N6 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Aknad1E9Q8N6 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Aknad1E9Q8N6 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Aknad1E9Q8N6 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Aknad1E9Q8N6 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Aknad1E9Q8N6 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Aknad1E9Q8N6 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Aknad1E9Q8N6 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Aknad1E9Q8N6 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Aknad1E9Q8N6 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Aknad1E9Q8N6 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Aknad1E9Q8N6 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Aknad1E9Q8N6 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Aknad1E9Q8N6 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Aknad1E9Q8N6 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Aknad1E9Q8N6 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Aknad1E9Q8N6 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Aknad1E9Q8N6 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Aknad1E9Q8N6 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Aknad1E9Q8N6 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Aknad1E9Q8N6 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Aknad1E9Q8N6 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Aknad1E9Q8N6 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Aknad1E9Q8N6 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Aknad1E9Q8N6 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Aknad1E9Q8N6 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Aknad1E9Q8N6 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms