Protein–RNA interactions for Protein: E9Q6R1

Itga10, Integrin, alpha 10, mousemouse

Predictions only

Length 1,167 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga10E9Q6R1 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Itga10E9Q6R1 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Itga10E9Q6R1 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Itga10E9Q6R1 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Itga10E9Q6R1 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Itga10E9Q6R1 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Itga10E9Q6R1 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Itga10E9Q6R1 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Itga10E9Q6R1 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Itga10E9Q6R1 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Itga10E9Q6R1 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Itga10E9Q6R1 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Itga10E9Q6R1 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Itga10E9Q6R1 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Itga10E9Q6R1 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Itga10E9Q6R1 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Itga10E9Q6R1 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Itga10E9Q6R1 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Itga10E9Q6R1 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Itga10E9Q6R1 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Itga10E9Q6R1 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Itga10E9Q6R1 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Itga10E9Q6R1 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Itga10E9Q6R1 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Itga10E9Q6R1 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Itga10E9Q6R1 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Itga10E9Q6R1 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Itga10E9Q6R1 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Itga10E9Q6R1 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Itga10E9Q6R1 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Itga10E9Q6R1 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Itga10E9Q6R1 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Itga10E9Q6R1 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Itga10E9Q6R1 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Itga10E9Q6R1 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Itga10E9Q6R1 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Itga10E9Q6R1 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Itga10E9Q6R1 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Itga10E9Q6R1 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Itga10E9Q6R1 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Itga10E9Q6R1 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Itga10E9Q6R1 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Itga10E9Q6R1 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Itga10E9Q6R1 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Itga10E9Q6R1 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Itga10E9Q6R1 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Itga10E9Q6R1 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Itga10E9Q6R1 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Itga10E9Q6R1 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Itga10E9Q6R1 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Itga10E9Q6R1 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Itga10E9Q6R1 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Itga10E9Q6R1 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Itga10E9Q6R1 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Itga10E9Q6R1 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Itga10E9Q6R1 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Itga10E9Q6R1 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Itga10E9Q6R1 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Itga10E9Q6R1 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Itga10E9Q6R1 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Itga10E9Q6R1 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Itga10E9Q6R1 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Itga10E9Q6R1 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Itga10E9Q6R1 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Itga10E9Q6R1 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Itga10E9Q6R1 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Itga10E9Q6R1 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Itga10E9Q6R1 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Itga10E9Q6R1 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Itga10E9Q6R1 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Itga10E9Q6R1 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Itga10E9Q6R1 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Itga10E9Q6R1 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Itga10E9Q6R1 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Itga10E9Q6R1 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Itga10E9Q6R1 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Itga10E9Q6R1 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Itga10E9Q6R1 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Itga10E9Q6R1 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Itga10E9Q6R1 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Itga10E9Q6R1 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Itga10E9Q6R1 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Itga10E9Q6R1 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Itga10E9Q6R1 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Itga10E9Q6R1 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Itga10E9Q6R1 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Itga10E9Q6R1 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Itga10E9Q6R1 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Itga10E9Q6R1 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Itga10E9Q6R1 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Itga10E9Q6R1 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Itga10E9Q6R1 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Itga10E9Q6R1 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Itga10E9Q6R1 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Itga10E9Q6R1 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Itga10E9Q6R1 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Itga10E9Q6R1 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Itga10E9Q6R1 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Itga10E9Q6R1 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Itga10E9Q6R1 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms