Protein–RNA interactions for Protein: E9Q6E9

Simc1, SUMO-interacting motifs-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Simc1E9Q6E9 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Simc1E9Q6E9 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Simc1E9Q6E9 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Simc1E9Q6E9 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Simc1E9Q6E9 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Simc1E9Q6E9 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Simc1E9Q6E9 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Simc1E9Q6E9 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Simc1E9Q6E9 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC25.95■■□□□ 1.75
Simc1E9Q6E9 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Simc1E9Q6E9 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.75
Simc1E9Q6E9 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Simc1E9Q6E9 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Simc1E9Q6E9 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Simc1E9Q6E9 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Simc1E9Q6E9 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Simc1E9Q6E9 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Simc1E9Q6E9 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Simc1E9Q6E9 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Simc1E9Q6E9 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Simc1E9Q6E9 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Simc1E9Q6E9 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
Simc1E9Q6E9 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
Simc1E9Q6E9 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Simc1E9Q6E9 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Simc1E9Q6E9 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Simc1E9Q6E9 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Simc1E9Q6E9 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Simc1E9Q6E9 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Simc1E9Q6E9 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Simc1E9Q6E9 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Simc1E9Q6E9 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Simc1E9Q6E9 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
Simc1E9Q6E9 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Simc1E9Q6E9 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Simc1E9Q6E9 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Simc1E9Q6E9 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Simc1E9Q6E9 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Simc1E9Q6E9 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Simc1E9Q6E9 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Simc1E9Q6E9 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Simc1E9Q6E9 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Simc1E9Q6E9 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Simc1E9Q6E9 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Simc1E9Q6E9 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Simc1E9Q6E9 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
Simc1E9Q6E9 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Simc1E9Q6E9 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
Simc1E9Q6E9 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Simc1E9Q6E9 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Simc1E9Q6E9 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Simc1E9Q6E9 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Simc1E9Q6E9 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
Simc1E9Q6E9 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Simc1E9Q6E9 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Simc1E9Q6E9 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Simc1E9Q6E9 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Simc1E9Q6E9 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Simc1E9Q6E9 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Simc1E9Q6E9 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Simc1E9Q6E9 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Simc1E9Q6E9 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Simc1E9Q6E9 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Simc1E9Q6E9 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Simc1E9Q6E9 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Simc1E9Q6E9 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
Simc1E9Q6E9 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Simc1E9Q6E9 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Simc1E9Q6E9 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Simc1E9Q6E9 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Simc1E9Q6E9 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Simc1E9Q6E9 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Simc1E9Q6E9 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Simc1E9Q6E9 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Simc1E9Q6E9 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Simc1E9Q6E9 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Simc1E9Q6E9 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Simc1E9Q6E9 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Simc1E9Q6E9 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Simc1E9Q6E9 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Simc1E9Q6E9 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Simc1E9Q6E9 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Simc1E9Q6E9 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Simc1E9Q6E9 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Simc1E9Q6E9 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Simc1E9Q6E9 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Simc1E9Q6E9 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Simc1E9Q6E9 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Simc1E9Q6E9 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Simc1E9Q6E9 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Simc1E9Q6E9 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Simc1E9Q6E9 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Simc1E9Q6E9 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Simc1E9Q6E9 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Simc1E9Q6E9 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Simc1E9Q6E9 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Simc1E9Q6E9 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Simc1E9Q6E9 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Simc1E9Q6E9 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Simc1E9Q6E9 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms