Protein–RNA interactions for Protein: E9Q557

Dsp, Desmoplakin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,883 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DspE9Q557 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
DspE9Q557 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
DspE9Q557 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
DspE9Q557 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
DspE9Q557 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
DspE9Q557 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
DspE9Q557 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
DspE9Q557 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
DspE9Q557 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
DspE9Q557 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
DspE9Q557 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
DspE9Q557 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
DspE9Q557 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
DspE9Q557 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
DspE9Q557 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
DspE9Q557 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
DspE9Q557 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
DspE9Q557 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
DspE9Q557 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
DspE9Q557 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
DspE9Q557 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
DspE9Q557 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
DspE9Q557 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
DspE9Q557 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
DspE9Q557 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
DspE9Q557 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
DspE9Q557 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
DspE9Q557 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
DspE9Q557 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
DspE9Q557 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
DspE9Q557 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
DspE9Q557 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
DspE9Q557 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
DspE9Q557 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
DspE9Q557 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
DspE9Q557 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
DspE9Q557 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
DspE9Q557 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
DspE9Q557 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
DspE9Q557 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
DspE9Q557 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
DspE9Q557 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
DspE9Q557 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
DspE9Q557 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
DspE9Q557 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
DspE9Q557 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
DspE9Q557 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
DspE9Q557 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
DspE9Q557 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
DspE9Q557 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
DspE9Q557 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
DspE9Q557 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
DspE9Q557 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
DspE9Q557 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
DspE9Q557 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
DspE9Q557 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
DspE9Q557 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
DspE9Q557 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
DspE9Q557 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
DspE9Q557 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
DspE9Q557 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
DspE9Q557 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
DspE9Q557 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
DspE9Q557 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
DspE9Q557 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
DspE9Q557 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
DspE9Q557 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
DspE9Q557 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
DspE9Q557 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
DspE9Q557 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
DspE9Q557 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
DspE9Q557 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
DspE9Q557 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
DspE9Q557 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
DspE9Q557 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
DspE9Q557 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
DspE9Q557 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
DspE9Q557 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
DspE9Q557 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
DspE9Q557 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
DspE9Q557 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
DspE9Q557 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
DspE9Q557 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
DspE9Q557 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
DspE9Q557 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
DspE9Q557 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
DspE9Q557 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
DspE9Q557 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
DspE9Q557 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
DspE9Q557 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
DspE9Q557 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
DspE9Q557 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
DspE9Q557 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
DspE9Q557 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
DspE9Q557 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
DspE9Q557 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
DspE9Q557 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
DspE9Q557 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
DspE9Q557 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
DspE9Q557 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms