Protein–RNA interactions for Protein: E9Q548

Gm20518, Predicted gene 20518, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20518E9Q548 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm20518E9Q548 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm20518E9Q548 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm20518E9Q548 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm20518E9Q548 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm20518E9Q548 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm20518E9Q548 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gm20518E9Q548 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gm20518E9Q548 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gm20518E9Q548 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Gm20518E9Q548 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gm20518E9Q548 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gm20518E9Q548 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gm20518E9Q548 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gm20518E9Q548 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gm20518E9Q548 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gm20518E9Q548 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gm20518E9Q548 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gm20518E9Q548 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gm20518E9Q548 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Gm20518E9Q548 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Gm20518E9Q548 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Gm20518E9Q548 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Gm20518E9Q548 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gm20518E9Q548 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gm20518E9Q548 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gm20518E9Q548 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gm20518E9Q548 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gm20518E9Q548 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gm20518E9Q548 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gm20518E9Q548 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gm20518E9Q548 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gm20518E9Q548 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gm20518E9Q548 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gm20518E9Q548 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gm20518E9Q548 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gm20518E9Q548 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gm20518E9Q548 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gm20518E9Q548 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gm20518E9Q548 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Gm20518E9Q548 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gm20518E9Q548 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gm20518E9Q548 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gm20518E9Q548 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gm20518E9Q548 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gm20518E9Q548 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gm20518E9Q548 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gm20518E9Q548 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gm20518E9Q548 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gm20518E9Q548 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gm20518E9Q548 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gm20518E9Q548 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gm20518E9Q548 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gm20518E9Q548 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gm20518E9Q548 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gm20518E9Q548 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gm20518E9Q548 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gm20518E9Q548 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Gm20518E9Q548 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gm20518E9Q548 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gm20518E9Q548 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gm20518E9Q548 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gm20518E9Q548 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gm20518E9Q548 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gm20518E9Q548 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm20518E9Q548 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm20518E9Q548 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm20518E9Q548 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm20518E9Q548 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm20518E9Q548 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm20518E9Q548 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm20518E9Q548 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm20518E9Q548 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm20518E9Q548 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm20518E9Q548 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm20518E9Q548 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm20518E9Q548 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm20518E9Q548 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm20518E9Q548 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm20518E9Q548 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm20518E9Q548 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm20518E9Q548 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm20518E9Q548 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm20518E9Q548 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm20518E9Q548 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm20518E9Q548 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm20518E9Q548 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm20518E9Q548 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm20518E9Q548 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm20518E9Q548 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm20518E9Q548 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm20518E9Q548 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm20518E9Q548 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm20518E9Q548 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm20518E9Q548 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm20518E9Q548 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm20518E9Q548 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm20518E9Q548 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm20518E9Q548 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm20518E9Q548 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms