Protein–RNA interactions for Protein: E9Q4Y8

8030474K03Rik, RIKEN cDNA 8030474K03 gene, mousemouse

Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
8030474K03RikE9Q4Y8 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
8030474K03RikE9Q4Y8 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
8030474K03RikE9Q4Y8 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
8030474K03RikE9Q4Y8 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
8030474K03RikE9Q4Y8 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
8030474K03RikE9Q4Y8 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
8030474K03RikE9Q4Y8 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
8030474K03RikE9Q4Y8 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
8030474K03RikE9Q4Y8 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
8030474K03RikE9Q4Y8 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
8030474K03RikE9Q4Y8 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
8030474K03RikE9Q4Y8 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
8030474K03RikE9Q4Y8 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
8030474K03RikE9Q4Y8 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
8030474K03RikE9Q4Y8 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
8030474K03RikE9Q4Y8 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
8030474K03RikE9Q4Y8 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
8030474K03RikE9Q4Y8 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
8030474K03RikE9Q4Y8 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
8030474K03RikE9Q4Y8 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
8030474K03RikE9Q4Y8 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
8030474K03RikE9Q4Y8 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
8030474K03RikE9Q4Y8 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
8030474K03RikE9Q4Y8 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
8030474K03RikE9Q4Y8 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
8030474K03RikE9Q4Y8 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
8030474K03RikE9Q4Y8 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
8030474K03RikE9Q4Y8 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
8030474K03RikE9Q4Y8 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
8030474K03RikE9Q4Y8 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
8030474K03RikE9Q4Y8 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
8030474K03RikE9Q4Y8 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
8030474K03RikE9Q4Y8 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
8030474K03RikE9Q4Y8 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
8030474K03RikE9Q4Y8 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
8030474K03RikE9Q4Y8 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
8030474K03RikE9Q4Y8 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
8030474K03RikE9Q4Y8 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
8030474K03RikE9Q4Y8 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
8030474K03RikE9Q4Y8 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
8030474K03RikE9Q4Y8 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
8030474K03RikE9Q4Y8 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
8030474K03RikE9Q4Y8 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
8030474K03RikE9Q4Y8 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
8030474K03RikE9Q4Y8 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
8030474K03RikE9Q4Y8 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
8030474K03RikE9Q4Y8 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
8030474K03RikE9Q4Y8 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
8030474K03RikE9Q4Y8 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
8030474K03RikE9Q4Y8 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
8030474K03RikE9Q4Y8 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
8030474K03RikE9Q4Y8 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
8030474K03RikE9Q4Y8 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
8030474K03RikE9Q4Y8 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
8030474K03RikE9Q4Y8 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
8030474K03RikE9Q4Y8 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
8030474K03RikE9Q4Y8 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
8030474K03RikE9Q4Y8 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
8030474K03RikE9Q4Y8 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
8030474K03RikE9Q4Y8 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
8030474K03RikE9Q4Y8 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
8030474K03RikE9Q4Y8 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
8030474K03RikE9Q4Y8 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
8030474K03RikE9Q4Y8 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
8030474K03RikE9Q4Y8 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
8030474K03RikE9Q4Y8 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
8030474K03RikE9Q4Y8 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
8030474K03RikE9Q4Y8 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
8030474K03RikE9Q4Y8 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
8030474K03RikE9Q4Y8 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
8030474K03RikE9Q4Y8 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
8030474K03RikE9Q4Y8 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
8030474K03RikE9Q4Y8 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
8030474K03RikE9Q4Y8 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
8030474K03RikE9Q4Y8 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
8030474K03RikE9Q4Y8 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
8030474K03RikE9Q4Y8 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
8030474K03RikE9Q4Y8 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
8030474K03RikE9Q4Y8 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
8030474K03RikE9Q4Y8 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
8030474K03RikE9Q4Y8 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
8030474K03RikE9Q4Y8 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
8030474K03RikE9Q4Y8 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
8030474K03RikE9Q4Y8 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
8030474K03RikE9Q4Y8 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
8030474K03RikE9Q4Y8 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
8030474K03RikE9Q4Y8 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
8030474K03RikE9Q4Y8 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
8030474K03RikE9Q4Y8 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
8030474K03RikE9Q4Y8 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
8030474K03RikE9Q4Y8 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
8030474K03RikE9Q4Y8 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
8030474K03RikE9Q4Y8 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
8030474K03RikE9Q4Y8 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
8030474K03RikE9Q4Y8 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
8030474K03RikE9Q4Y8 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
8030474K03RikE9Q4Y8 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
8030474K03RikE9Q4Y8 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
8030474K03RikE9Q4Y8 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
8030474K03RikE9Q4Y8 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms