Protein–RNA interactions for Protein: E9Q368

Tarbp1, TAR RNA-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tarbp1E9Q368 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Tarbp1E9Q368 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Tarbp1E9Q368 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Tarbp1E9Q368 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Tarbp1E9Q368 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Tarbp1E9Q368 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Tarbp1E9Q368 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Tarbp1E9Q368 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
Tarbp1E9Q368 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
Tarbp1E9Q368 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Tarbp1E9Q368 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Tarbp1E9Q368 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Tarbp1E9Q368 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Tarbp1E9Q368 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Tarbp1E9Q368 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Tarbp1E9Q368 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Tarbp1E9Q368 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Tarbp1E9Q368 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Tarbp1E9Q368 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Tarbp1E9Q368 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Tarbp1E9Q368 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Tarbp1E9Q368 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Tarbp1E9Q368 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Tarbp1E9Q368 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
Tarbp1E9Q368 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Tarbp1E9Q368 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
Tarbp1E9Q368 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Tarbp1E9Q368 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
Tarbp1E9Q368 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.17
Tarbp1E9Q368 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Tarbp1E9Q368 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
Tarbp1E9Q368 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Tarbp1E9Q368 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Tarbp1E9Q368 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Tarbp1E9Q368 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Tarbp1E9Q368 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Tarbp1E9Q368 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Tarbp1E9Q368 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Tarbp1E9Q368 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Tarbp1E9Q368 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Tarbp1E9Q368 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Tarbp1E9Q368 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Tarbp1E9Q368 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Tarbp1E9Q368 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Tarbp1E9Q368 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Tarbp1E9Q368 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Tarbp1E9Q368 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Tarbp1E9Q368 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Tarbp1E9Q368 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Tarbp1E9Q368 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Tarbp1E9Q368 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
Tarbp1E9Q368 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Tarbp1E9Q368 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Tarbp1E9Q368 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Tarbp1E9Q368 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Tarbp1E9Q368 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Tarbp1E9Q368 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Tarbp1E9Q368 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Tarbp1E9Q368 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Tarbp1E9Q368 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Tarbp1E9Q368 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Tarbp1E9Q368 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Tarbp1E9Q368 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Tarbp1E9Q368 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Tarbp1E9Q368 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Tarbp1E9Q368 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
Tarbp1E9Q368 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Tarbp1E9Q368 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.16
Tarbp1E9Q368 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Tarbp1E9Q368 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Tarbp1E9Q368 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Tarbp1E9Q368 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Tarbp1E9Q368 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Tarbp1E9Q368 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Tarbp1E9Q368 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Tarbp1E9Q368 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Tarbp1E9Q368 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Tarbp1E9Q368 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Tarbp1E9Q368 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Tarbp1E9Q368 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
Tarbp1E9Q368 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Tarbp1E9Q368 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Tarbp1E9Q368 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Tarbp1E9Q368 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Tarbp1E9Q368 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
Tarbp1E9Q368 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Tarbp1E9Q368 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Tarbp1E9Q368 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Tarbp1E9Q368 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Tarbp1E9Q368 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Tarbp1E9Q368 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Tarbp1E9Q368 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Tarbp1E9Q368 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Tarbp1E9Q368 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Tarbp1E9Q368 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Tarbp1E9Q368 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Tarbp1E9Q368 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Tarbp1E9Q368 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Tarbp1E9Q368 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Tarbp1E9Q368 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.3 ms