Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1U1

Ccdc171, Coiled-coil domain-containing protein 171, mousemouse

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Length 1,324 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc171E9Q1U1 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ccdc171E9Q1U1 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ccdc171E9Q1U1 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ccdc171E9Q1U1 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ccdc171E9Q1U1 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Ccdc171E9Q1U1 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ccdc171E9Q1U1 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ccdc171E9Q1U1 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ccdc171E9Q1U1 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ccdc171E9Q1U1 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ccdc171E9Q1U1 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ccdc171E9Q1U1 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ccdc171E9Q1U1 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ccdc171E9Q1U1 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ccdc171E9Q1U1 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ccdc171E9Q1U1 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ccdc171E9Q1U1 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ccdc171E9Q1U1 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ccdc171E9Q1U1 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ccdc171E9Q1U1 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ccdc171E9Q1U1 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ccdc171E9Q1U1 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ccdc171E9Q1U1 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ccdc171E9Q1U1 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ccdc171E9Q1U1 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ccdc171E9Q1U1 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ccdc171E9Q1U1 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ccdc171E9Q1U1 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ccdc171E9Q1U1 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ccdc171E9Q1U1 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ccdc171E9Q1U1 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ccdc171E9Q1U1 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ccdc171E9Q1U1 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ccdc171E9Q1U1 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ccdc171E9Q1U1 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ccdc171E9Q1U1 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Ccdc171E9Q1U1 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Ccdc171E9Q1U1 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ccdc171E9Q1U1 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ccdc171E9Q1U1 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ccdc171E9Q1U1 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ccdc171E9Q1U1 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ccdc171E9Q1U1 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ccdc171E9Q1U1 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ccdc171E9Q1U1 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ccdc171E9Q1U1 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ccdc171E9Q1U1 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ccdc171E9Q1U1 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ccdc171E9Q1U1 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ccdc171E9Q1U1 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ccdc171E9Q1U1 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ccdc171E9Q1U1 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ccdc171E9Q1U1 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ccdc171E9Q1U1 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ccdc171E9Q1U1 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ccdc171E9Q1U1 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ccdc171E9Q1U1 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ccdc171E9Q1U1 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ccdc171E9Q1U1 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ccdc171E9Q1U1 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ccdc171E9Q1U1 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ccdc171E9Q1U1 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ccdc171E9Q1U1 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ccdc171E9Q1U1 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ccdc171E9Q1U1 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ccdc171E9Q1U1 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ccdc171E9Q1U1 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ccdc171E9Q1U1 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ccdc171E9Q1U1 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ccdc171E9Q1U1 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ccdc171E9Q1U1 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ccdc171E9Q1U1 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ccdc171E9Q1U1 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ccdc171E9Q1U1 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ccdc171E9Q1U1 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ccdc171E9Q1U1 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ccdc171E9Q1U1 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ccdc171E9Q1U1 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ccdc171E9Q1U1 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Ccdc171E9Q1U1 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ccdc171E9Q1U1 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ccdc171E9Q1U1 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ccdc171E9Q1U1 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ccdc171E9Q1U1 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ccdc171E9Q1U1 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ccdc171E9Q1U1 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ccdc171E9Q1U1 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ccdc171E9Q1U1 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ccdc171E9Q1U1 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ccdc171E9Q1U1 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ccdc171E9Q1U1 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Ccdc171E9Q1U1 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ccdc171E9Q1U1 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ccdc171E9Q1U1 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ccdc171E9Q1U1 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Ccdc171E9Q1U1 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Ccdc171E9Q1U1 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ccdc171E9Q1U1 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ccdc171E9Q1U1 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Ccdc171E9Q1U1 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
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