Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1M1

Pdzd2, PDZ domain-containing 2, mousemouse

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Length 2,796 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd2E9Q1M1 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
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Pdzd2E9Q1M1 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pdzd2E9Q1M1 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pdzd2E9Q1M1 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pdzd2E9Q1M1 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Pdzd2E9Q1M1 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
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Pdzd2E9Q1M1 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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Pdzd2E9Q1M1 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
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Pdzd2E9Q1M1 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pdzd2E9Q1M1 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pdzd2E9Q1M1 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pdzd2E9Q1M1 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pdzd2E9Q1M1 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pdzd2E9Q1M1 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pdzd2E9Q1M1 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pdzd2E9Q1M1 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pdzd2E9Q1M1 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pdzd2E9Q1M1 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pdzd2E9Q1M1 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pdzd2E9Q1M1 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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Pdzd2E9Q1M1 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
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Pdzd2E9Q1M1 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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Pdzd2E9Q1M1 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pdzd2E9Q1M1 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Pdzd2E9Q1M1 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pdzd2E9Q1M1 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pdzd2E9Q1M1 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Pdzd2E9Q1M1 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pdzd2E9Q1M1 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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Pdzd2E9Q1M1 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pdzd2E9Q1M1 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pdzd2E9Q1M1 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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Pdzd2E9Q1M1 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pdzd2E9Q1M1 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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Pdzd2E9Q1M1 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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Pdzd2E9Q1M1 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pdzd2E9Q1M1 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pdzd2E9Q1M1 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pdzd2E9Q1M1 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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Pdzd2E9Q1M1 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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Pdzd2E9Q1M1 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pdzd2E9Q1M1 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pdzd2E9Q1M1 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pdzd2E9Q1M1 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pdzd2E9Q1M1 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Pdzd2E9Q1M1 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Pdzd2E9Q1M1 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pdzd2E9Q1M1 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pdzd2E9Q1M1 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pdzd2E9Q1M1 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Pdzd2E9Q1M1 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Pdzd2E9Q1M1 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Pdzd2E9Q1M1 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pdzd2E9Q1M1 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pdzd2E9Q1M1 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pdzd2E9Q1M1 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pdzd2E9Q1M1 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pdzd2E9Q1M1 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pdzd2E9Q1M1 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pdzd2E9Q1M1 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pdzd2E9Q1M1 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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